40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1721 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  100 
 
 
74 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  56.76 
 
 
74 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  55.41 
 
 
81 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  56.76 
 
 
74 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  52.7 
 
 
74 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  54.05 
 
 
74 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  48.65 
 
 
74 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  47.3 
 
 
74 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.24 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  44 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  44.59 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  37.84 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  43.06 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  36.49 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  35.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  32.91 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  37.84 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  30.38 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  30.23 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  30.23 
 
 
84 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  33.78 
 
 
74 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  33.78 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  32.56 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  35.8 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0822  thiamineS protein  32.05 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000395067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  33.33 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  32.14 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  32.47 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  34.18 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.38 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  30.12 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  29.87 
 
 
77 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  33.33 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  28.57 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0649  MoaD family protein  31.33 
 
 
229 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.321088  hitchhiker  0.00441005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.75 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1853  thiamineS protein  32.47 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.479134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  29.76 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  34.04 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  27.03 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>