57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1707 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 
74 aa  147  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  48 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  50 
 
 
74 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  47.3 
 
 
74 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  48.65 
 
 
74 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  51.35 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  45.95 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  45.95 
 
 
74 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  43.24 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  50 
 
 
74 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  40.54 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  45.45 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  40.74 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  45.83 
 
 
73 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  43.24 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  35.44 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  38.96 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  37.84 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  39.24 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  36.71 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  37.66 
 
 
78 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  34.88 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  43.14 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  33.78 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  40.91 
 
 
247 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  40.91 
 
 
264 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  31.65 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  36.36 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  36.36 
 
 
251 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  36.84 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  38.64 
 
 
251 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  35.44 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  41.46 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2481  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.9 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  38.64 
 
 
251 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  38.64 
 
 
251 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  36.36 
 
 
251 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  38.64 
 
 
251 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  34.88 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  36.36 
 
 
266 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  33.9 
 
 
251 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  36.36 
 
 
253 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  33.33 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  36.36 
 
 
251 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  33.33 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2368  MoaD family protein  34.57 
 
 
228 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0649  MoaD family protein  29.63 
 
 
229 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.321088  hitchhiker  0.00441005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  28.57 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  39.58 
 
 
268 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  32.14 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.87 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  36.21 
 
 
255 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  30.95 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  25.68 
 
 
244 aa  40  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>