13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0973 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0973  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3287  hypothetical protein  93.68 
 
 
95 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2429  hypothetical protein  58.43 
 
 
105 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0150509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1649  hypothetical protein  46.46 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00308547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2870  hypothetical protein  51.19 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0617124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0070  hypothetical protein  49.37 
 
 
102 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0408  thiamineS protein  39.02 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2272  hypothetical protein  38.55 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0378  hypothetical protein  39.24 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1954  hypothetical protein  36.14 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1701  thiamineS protein  42.22 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00127323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  36.73 
 
 
78 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  44.23 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>