14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3287 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3287  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0973  hypothetical protein  93.68 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2429  hypothetical protein  55.06 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0150509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1649  hypothetical protein  45.45 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00308547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2870  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0617124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0070  hypothetical protein  45.57 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0408  thiamineS protein  39.02 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2272  hypothetical protein  37.04 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1954  hypothetical protein  36.14 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1701  thiamineS protein  37.04 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00127323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  38 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  44.23 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  33.8 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>