14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2502 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2502  thiamineS protein  100 
 
 
109 aa  223  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00382478  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1701  thiamineS protein  46.51 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00127323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2272  hypothetical protein  41.49 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0408  thiamineS protein  44.19 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1954  hypothetical protein  39.08 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0070  hypothetical protein  37.21 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2429  hypothetical protein  34.52 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0150509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0378  hypothetical protein  37.78 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1649  hypothetical protein  36.59 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00308547  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  40 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  43.48 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  45.24 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  40.91 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2870  hypothetical protein  32.88 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0617124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>