More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0756 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0756  aminotransferase class V  100 
 
 		 387 aa  786    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000203791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.04 
 
 		 382 aa  348  6e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.7 
 
 		 392 aa  348  8e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  45.34 
 
 		 392 aa  346  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  48.58 
 
 		 392 aa  345  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.64 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.78 
 
 		 384 aa  342  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.63 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.52 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.52 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.45 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  45.31 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.47 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  44.27 
 
 		 396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  44.3 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.78 
 
 		 398 aa  318  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.26 
 
 		 388 aa  318  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  45 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.6 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.19 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.19 
 
 		 388 aa  315  7e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  44.88 
 
 		 382 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.3 
 
 		 398 aa  311  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  43.23 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  41.97 
 
 		 406 aa  309  5e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.64 
 
 		 396 aa  308  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.08 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  43.38 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  43.38 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.31 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  42.16 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.36 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  43.46 
 
 		 393 aa  298  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.83 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  39.16 
 
 		 389 aa  288  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  43.2 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  42.05 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  40 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.66 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.09 
 
 		 404 aa  282  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  40.38 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  41.21 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  41.34 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  41.45 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  38.7 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.57 
 
 		 401 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  40.72 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  38.96 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  40.38 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  41.34 
 
 		 404 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  40.83 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  40.83 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  41.12 
 
 		 408 aa  278  9e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  40.11 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  40.11 
 
 		 381 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  38.64 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  40.11 
 
 		 381 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  41.3 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  43.65 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.86 
 
 		 400 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  275  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 404 aa  275  8e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 381 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  40.96 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  39.9 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  39.48 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  39.48 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  39.22 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  38.96 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  40.51 
 
 		 404 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  39.22 
 
 		 407 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>