More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  97.52 
 
 
445 aa  866    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  93.92 
 
 
444 aa  826    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
444 aa  913    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  43.15 
 
 
446 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 
446 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 
446 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 
446 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 
446 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  43.15 
 
 
446 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 
446 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  43.31 
 
 
446 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 
446 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  42.66 
 
 
446 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  41.88 
 
 
440 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  41.83 
 
 
450 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  43.08 
 
 
446 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  41.61 
 
 
450 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.48 
 
 
456 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.04 
 
 
453 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.9 
 
 
454 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 
472 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  41.42 
 
 
441 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  40.41 
 
 
442 aa  349  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.77 
 
 
463 aa  348  8e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  39.16 
 
 
481 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  38.5 
 
 
457 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  39.66 
 
 
480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  38.5 
 
 
457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  39.66 
 
 
478 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.36 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  40.73 
 
 
443 aa  335  7e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.77 
 
 
443 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.18 
 
 
453 aa  329  6e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.48 
 
 
449 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  37.36 
 
 
443 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  38.44 
 
 
451 aa  323  3e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.16 
 
 
458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  37.18 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  39.05 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  39.6 
 
 
453 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  39.6 
 
 
453 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 
453 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 
453 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  38.28 
 
 
460 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  36.85 
 
 
490 aa  315  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.46 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  36.07 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  37.28 
 
 
482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  40.28 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.9 
 
 
447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.24 
 
 
450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.61 
 
 
591 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  36.48 
 
 
492 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.61 
 
 
587 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  36.62 
 
 
491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  36.7 
 
 
487 aa  307  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.73 
 
 
446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.27 
 
 
444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  36.13 
 
 
491 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.69 
 
 
480 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  38.36 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.35 
 
 
721 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.93 
 
 
503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  38.23 
 
 
453 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  38.02 
 
 
456 aa  302  8.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.54 
 
 
454 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  38.12 
 
 
464 aa  300  4e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.44 
 
 
566 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  35.45 
 
 
460 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.84 
 
 
480 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  39.27 
 
 
492 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 
490 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.64 
 
 
461 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.92 
 
 
527 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  43.63 
 
 
597 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  45.88 
 
 
582 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  35.64 
 
 
477 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  37.97 
 
 
452 aa  289  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.69 
 
 
474 aa  289  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38 
 
 
473 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.31 
 
 
528 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.76 
 
 
570 aa  286  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.56 
 
 
455 aa  286  7e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  44.72 
 
 
494 aa  285  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.57 
 
 
515 aa  285  9e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  43.92 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  35.25 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  44.55 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.7 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  43.92 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  43.92 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  43.36 
 
 
440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.52 
 
 
534 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  37.39 
 
 
459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.72 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3309  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.72 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  35.65 
 
 
454 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  36.18 
 
 
451 aa  282  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.18 
 
 
451 aa  282  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.08 
 
 
469 aa  282  8.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>