More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2799 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2799  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 365 aa  747    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2236  AraC family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 272 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 312 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6605  AraC family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 354 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0589608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 315 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6678  AraC family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41036  normal  0.11497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5835  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6202  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  39.4 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 329 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 320 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  38.93 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  39.19 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  37.19 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  37.2 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 320 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  36.05 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  37.16 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  34.68 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 327 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5449  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109166 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  33.79 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  34.24 
 
 		 311 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  37.88 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  37.5 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3531  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4835  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 313 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  34.69 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 305 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3606  AraC-like transcriptional regulator  36.21 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  31.92 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3330  AraC-like transcriptional regulator  36.65 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  38.19 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2738  AraC-type transcriptional regulator domain protein  37.71 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 311 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  35.15 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5491  transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0109  AraC-like transcriptional regulator  37.04 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  hitchhiker  0.00915457 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0877  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 298 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000157744  decreased coverage  0.000000000198967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 303 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2283  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 330 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0736  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2611  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3214  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5657  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 299 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  34.31 
 
 		 299 aa  156  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3721  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0850692  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4647  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3543  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  34.34 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0733434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1064  AraC-like transcriptional regulator  35.27 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0810  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.542883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0723  AraC-like transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2712  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.974943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3720  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44403  normal  0.422333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0625  transcription regulator protein  34.81 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0407  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2598  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  34.41 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>