More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1779 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1779  tRNA-adenosine deaminase  100 
 
 
172 aa  356  9e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.073182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0169  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.16 
 
 
175 aa  191  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.25 
 
 
161 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.72 
 
 
165 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.46 
 
 
190 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.05 
 
 
195 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.16 
 
 
475 aa  151  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.42 
 
 
152 aa  147  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.75 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  53.38 
 
 
152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.69 
 
 
158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  48 
 
 
160 aa  145  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  54.89 
 
 
137 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  50.65 
 
 
176 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.47 
 
 
153 aa  141  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.24 
 
 
142 aa  141  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
151 aa  140  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.94 
 
 
363 aa  140  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  53.06 
 
 
168 aa  140  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.63 
 
 
152 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  52.38 
 
 
168 aa  137  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  51.7 
 
 
165 aa  137  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.05 
 
 
154 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  51.01 
 
 
178 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.01 
 
 
167 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  51.01 
 
 
167 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  51.01 
 
 
178 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  51.01 
 
 
178 aa  137  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  51.01 
 
 
178 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  51.01 
 
 
178 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  45.56 
 
 
200 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
167 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
159 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  51.05 
 
 
144 aa  136  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.63 
 
 
164 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  49.66 
 
 
169 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  45.56 
 
 
200 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  45.56 
 
 
187 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
148 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
148 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1476  tRNA-adenosine deaminase  54.26 
 
 
176 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.78 
 
 
484 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.65 
 
 
168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  48.32 
 
 
149 aa  134  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
172 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
172 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
172 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  48.32 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  49.33 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.62 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.54 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.62 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  46.54 
 
 
165 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.22 
 
 
223 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.32 
 
 
189 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.92 
 
 
174 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  47.62 
 
 
177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.92 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  53.1 
 
 
205 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.37 
 
 
158 aa  131  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
411 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  48.08 
 
 
183 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  46.9 
 
 
195 aa  130  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.83 
 
 
151 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  49.33 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.05 
 
 
182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.75 
 
 
149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.39 
 
 
461 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.23 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.8 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.76 
 
 
361 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.76 
 
 
361 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  50.35 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.21 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.66 
 
 
167 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.85 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.01 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.15 
 
 
162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  46.62 
 
 
170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  45.52 
 
 
161 aa  127  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.69 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.48 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.86 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.44 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.32 
 
 
154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  49.22 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  48.67 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.56 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.78 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  46.21 
 
 
158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  47.92 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.52 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>