227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0984 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0984  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 381 aa  782    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1946  Phosphoserine transaminase  73.15 
 
 		 371 aa  558  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0109245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1625  phosphoserine aminotransferase  53.06 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2651  phosphoserine aminotransferase  52.78 
 
 		 364 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2127  phosphoserine aminotransferase  53.06 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3187  phosphoserine aminotransferase  53.06 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1401  phosphoserine aminotransferase  53.06 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2512  phosphoserine aminotransferase  52.78 
 
 		 364 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2565  phosphoserine aminotransferase  52.5 
 
 		 364 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1966  phosphoserine aminotransferase  53.22 
 
 		 364 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  47.59 
 
 		 361 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  47.88 
 
 		 361 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  47.21 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  45.92 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  44.76 
 
 		 360 aa  322  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  46.78 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  46.33 
 
 		 361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  46.37 
 
 		 361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  45.94 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  42.46 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  45.53 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  44.01 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  45.53 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  45.81 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  45.53 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  45.92 
 
 		 362 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  45.33 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  48.17 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  44.57 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  45.25 
 
 		 361 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  43.98 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  45.22 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  45.81 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  45.53 
 
 		 361 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  44.41 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  44.41 
 
 		 359 aa  307  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  42.78 
 
 		 362 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  44.97 
 
 		 361 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  47.34 
 
 		 372 aa  305  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  45.53 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  46.8 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  44.63 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  44.13 
 
 		 361 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  43.58 
 
 		 361 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  46.09 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  44.41 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  41.62 
 
 		 360 aa  298  8e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  43.3 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  43.65 
 
 		 373 aa  292  7e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  41.67 
 
 		 360 aa  292  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  42.13 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  41.24 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  41.67 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  41.94 
 
 		 360 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  43.09 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  43.68 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  41.94 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  41.67 
 
 		 367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  41.94 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1599  phosphoserine aminotransferase  43.77 
 
 		 359 aa  289  7e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.534688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  42.54 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  41.39 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  40 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  41.53 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  46.06 
 
 		 335 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  42.03 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1139  phosphoserine aminotransferase  42.21 
 
 		 356 aa  285  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444246  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  43.3 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  46.06 
 
 		 335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  45.96 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  42.7 
 
 		 364 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  41.39 
 
 		 360 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  41.39 
 
 		 360 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  42.78 
 
 		 358 aa  282  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  42.34 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  40.56 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  42.22 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  41.58 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  41.94 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  40.68 
 
 		 361 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  40.28 
 
 		 360 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  40.88 
 
 		 361 aa  279  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  42.62 
 
 		 361 aa  278  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  43.42 
 
 		 359 aa  279  8e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  40.56 
 
 		 360 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  41.76 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  42.06 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2462  phosphoserine aminotransferase  43.26 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  41.83 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  41.78 
 
 		 361 aa  275  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  41.55 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  41.55 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  40.62 
 
 		 359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  41.55 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  41.55 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  43.42 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  41.55 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  41.55 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>