213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1946 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1946  Phosphoserine transaminase  100 
 
 		 371 aa  769    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0109245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0984  phosphoserine aminotransferase  73.15 
 
 		 381 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1625  phosphoserine aminotransferase  51.82 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2127  phosphoserine aminotransferase  51.82 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3187  phosphoserine aminotransferase  51.82 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1401  phosphoserine aminotransferase  51.82 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2651  phosphoserine aminotransferase  51.69 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2512  phosphoserine aminotransferase  51.54 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2565  phosphoserine aminotransferase  51.26 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1966  phosphoserine aminotransferase  50.42 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  44.2 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  46.2 
 
 		 361 aa  319  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  45.63 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  44.88 
 
 		 362 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  43.63 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  48.17 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  45.79 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  45.51 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  43.54 
 
 		 359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  43.85 
 
 		 360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  41.57 
 
 		 360 aa  305  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  43.33 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  42.46 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  42.02 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  42.46 
 
 		 361 aa  299  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  42.9 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  41.74 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  43.26 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  43.66 
 
 		 361 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  43.42 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  42.5 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  43.66 
 
 		 360 aa  292  8e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  42.78 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  41.8 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  44.38 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  42.7 
 
 		 360 aa  289  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  41.62 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  43.25 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  41.69 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  43.85 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  43.3 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  42.78 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  41.41 
 
 		 360 aa  283  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  40.11 
 
 		 360 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 		 395 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  40.22 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  42.58 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  42.02 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  41.74 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  40.56 
 
 		 360 aa  279  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  40.68 
 
 		 360 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  40.73 
 
 		 361 aa  278  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  38.78 
 
 		 387 aa  276  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  39.89 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  40.96 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1962  phosphoserine aminotransferase  41.57 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  40.68 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  39.44 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  42.02 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1538  phosphoserine aminotransferase  40.45 
 
 		 360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0905864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  40.68 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1139  phosphoserine aminotransferase  40.51 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444246  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  40.17 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  39.28 
 
 		 364 aa  271  9e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0254  phosphoserine aminotransferase  42.06 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.258322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  39.44 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  39.83 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  40.22 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  40.4 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  40.45 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  39.94 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  40.11 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  39.83 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0371  phosphoserine aminotransferase  40.5 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  40.11 
 
 		 360 aa  269  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  41.64 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1373  phosphoserine aminotransferase  39.22 
 
 		 362 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1632  phosphoserine aminotransferase  40.5 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1599  phosphoserine aminotransferase  40.77 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.534688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  41.32 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  41.29 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  40.67 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  41.06 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  40.67 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  40.67 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  40.67 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  40.67 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  40.67 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0348  phosphoserine aminotransferase  40.22 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  40.67 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  41.74 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2462  phosphoserine aminotransferase  41.41 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51224  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1369  phosphoserine aminotransferase  39.5 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  39.5 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  39.5 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>