246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2565 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1625  phosphoserine aminotransferase  99.18 
 
 
364 aa  742    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2651  phosphoserine aminotransferase  99.45 
 
 
364 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1966  phosphoserine aminotransferase  91.76 
 
 
364 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1401  phosphoserine aminotransferase  99.18 
 
 
364 aa  742    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2127  phosphoserine aminotransferase  99.18 
 
 
364 aa  742    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3187  phosphoserine aminotransferase  99.18 
 
 
364 aa  742    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2512  phosphoserine aminotransferase  99.18 
 
 
364 aa  743    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2565  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
364 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1946  Phosphoserine transaminase  51.26 
 
 
371 aa  384  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0109245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0984  phosphoserine aminotransferase  52.5 
 
 
381 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 
360 aa  346  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  46.39 
 
 
362 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 
358 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  47.34 
 
 
361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  46.18 
 
 
360 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  45.94 
 
 
361 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  43.14 
 
 
360 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
360 aa  315  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  42.58 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  42.31 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  42.58 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  42.58 
 
 
360 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 
360 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  42.58 
 
 
360 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  42.58 
 
 
360 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  43.65 
 
 
363 aa  309  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  42.02 
 
 
360 aa  308  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  45.13 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  42.98 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  44.01 
 
 
361 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 
360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  43.45 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  43.33 
 
 
361 aa  301  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  42.78 
 
 
361 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  41.94 
 
 
362 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  43.53 
 
 
359 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  41.67 
 
 
361 aa  300  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  41.81 
 
 
362 aa  299  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  40.06 
 
 
360 aa  298  8e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  42.18 
 
 
360 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  41.9 
 
 
360 aa  295  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  43.33 
 
 
360 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  42.9 
 
 
361 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  42.7 
 
 
361 aa  291  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  43.13 
 
 
361 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  44.48 
 
 
359 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  41.92 
 
 
362 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  41.92 
 
 
362 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  43.24 
 
 
360 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  39.89 
 
 
387 aa  289  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  43.05 
 
 
361 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  42.46 
 
 
361 aa  288  7e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  40.34 
 
 
360 aa  288  9e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  41.62 
 
 
360 aa  288  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  41.53 
 
 
361 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  42.46 
 
 
360 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  46.05 
 
 
363 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  43.45 
 
 
359 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  41.78 
 
 
361 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  38.89 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1599  phosphoserine aminotransferase  42.15 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.534688  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  42.23 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  40.87 
 
 
361 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 
364 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  41.69 
 
 
363 aa  281  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  41.5 
 
 
360 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  40.6 
 
 
395 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1538  phosphoserine aminotransferase  41.23 
 
 
360 aa  279  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0905864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  42.78 
 
 
372 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  40.39 
 
 
359 aa  278  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1719  phosphoserine aminotransferase  39.95 
 
 
375 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.442694 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  39.66 
 
 
364 aa  276  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  38.78 
 
 
361 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  39.78 
 
 
359 aa  276  4e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00717  phosphoserine aminotransferase  40.5 
 
 
361 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  39.19 
 
 
367 aa  275  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  39.73 
 
 
364 aa  275  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2078  phosphoserine aminotransferase  41.27 
 
 
361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  40.5 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0371  phosphoserine aminotransferase  39.39 
 
 
358 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0348  phosphoserine aminotransferase  39.12 
 
 
358 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1632  phosphoserine aminotransferase  38.84 
 
 
358 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  39.45 
 
 
354 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  40.81 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  40.82 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  39.41 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1498  phosphoserine aminotransferase  39.66 
 
 
360 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  39.89 
 
 
365 aa  268  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1369  phosphoserine aminotransferase  37.95 
 
 
362 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1373  phosphoserine aminotransferase  37.12 
 
 
362 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1920  phosphoserine aminotransferase  40.27 
 
 
363 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00965708  hitchhiker  0.00000000132125 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1973  phosphoserine aminotransferase  40.27 
 
 
363 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000290161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  39.44 
 
 
354 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  40.33 
 
 
379 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2708  phosphoserine aminotransferase  40.91 
 
 
375 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2803  phosphoserine aminotransferase  40.91 
 
 
375 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2058  phosphoserine aminotransferase  40 
 
 
363 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00301752  unclonable  0.0000270653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2307  phosphoserine aminotransferase  39.07 
 
 
364 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0347378  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2410  phosphoserine aminotransferase  40.65 
 
 
367 aa  263  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>