51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3938 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3938  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 428 aa  876    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.479831  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  30.54 
 
 		 597 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  29.49 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  31.01 
 
 		 750 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.14 
 
 		 261 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 260 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 210 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 349 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 750 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0291  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444686  normal  0.420509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1421 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.57 
 
 		 614 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.03 
 
 		 357 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 804 aa  46.6  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 629 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0428  TPR domain-containing protein  32.85 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.562836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1060  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1089  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.527796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  25.58 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 1486 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.12 
 
 		 746 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.22 
 
 		 706 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 974 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  44.9 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.446207 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 211 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.57 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1827 aa  44.3  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  31.29 
 
 		 581 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 284 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.03 
 
 		 1056 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 927 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.68 
 
 		 406 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 649 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.68 
 
 		 406 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  25.75 
 
 		 695 aa  43.1  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>