More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3076 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3076  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 367 aa  755    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.504729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2261  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  51.61 
 
 		 346 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0127  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  48.28 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1365  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  44.05 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1264  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  43.75 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  42.86 
 
 		 341 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.704538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1275  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  41.74 
 
 		 343 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1151  hypothetical protein  41.39 
 
 		 347 aa  270  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  31.45 
 
 		 290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00520  arginase  31.52 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.960091  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1538  agmatinase  29.71 
 
 		 289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.04187  unclonable  1.26381e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1609  agmatinase  31.51 
 
 		 291 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0169673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2044  agmatinase  30.86 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.661997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3564  putative agmatinase  31.35 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  30.9 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  30.07 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4857  putative agmatinase  29 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0574  agmatinase, putative  31 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0074  agmatinase  28.62 
 
 		 294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2696  agmatinase  30 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3780  putative agmatinase  28.26 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.547694 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1313  agmatinase  29.97 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501351  normal  0.021834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  29.85 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0733  agmatinase  29.53 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.983963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0838  agmatinase  29.53 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  29.47 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  29.67 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  29.04 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  27.44 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  28.15 
 
 		 282 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  28.3 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  27.65 
 
 		 306 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  33.96 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  28.77 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  27.91 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  32.58 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  33.01 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  33.01 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  27.06 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  32.02 
 
 		 293 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  29.45 
 
 		 288 aa  99.8  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  25.31 
 
 		 285 aa  99.8  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  28.57 
 
 		 280 aa  99  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  30 
 
 		 288 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  32.34 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  27.83 
 
 		 319 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  27.24 
 
 		 309 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  27.83 
 
 		 319 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  27.83 
 
 		 319 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  26.49 
 
 		 319 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  32.09 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  34.13 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  26.49 
 
 		 319 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  31.72 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  32.69 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  26.75 
 
 		 319 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  24.17 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  26.87 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  27.51 
 
 		 310 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  26.83 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  30.91 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  27.44 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  29.91 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  27.44 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  25 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  25.55 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  26.83 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  26.83 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  32.57 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  26.92 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  27.81 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  26.32 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  30.7 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  30.89 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  27.48 
 
 		 290 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  26.92 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  29.25 
 
 		 323 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  27.27 
 
 		 290 aa  92.8  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  25.3 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  26.73 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  25.68 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  26.73 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  26.73 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  26.73 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  26.73 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  25.71 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  26.82 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  26.73 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  28.99 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  26.73 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  26.73 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  26.73 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  32.13 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  28.79 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  25.8 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  27.95 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  26.27 
 
 		 284 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  30.69 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  25.53 
 
 		 309 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  26.81 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>