More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0574 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0574  agmatinase, putative  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  62.72 
 
 
290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0074  agmatinase  54.24 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3780  putative agmatinase  38.46 
 
 
303 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.547694 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1538  agmatinase  35.04 
 
 
289 aa  186  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.04187  unclonable  1.26381e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  37.01 
 
 
295 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3564  putative agmatinase  40.14 
 
 
296 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263603  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2696  agmatinase  37.04 
 
 
305 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0838  agmatinase  37.16 
 
 
293 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0733  agmatinase  37.29 
 
 
293 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.983963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  38.63 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00520  arginase  33.83 
 
 
316 aa  168  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.960091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4857  putative agmatinase  34.59 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1313  agmatinase  37.14 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501351  normal  0.021834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1609  agmatinase  35.66 
 
 
291 aa  143  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  32.39 
 
 
293 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  32.41 
 
 
293 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1365  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.13 
 
 
341 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.01 
 
 
341 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.704538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1264  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.13 
 
 
341 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  32.57 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2044  agmatinase  31.07 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.661997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1275  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.54 
 
 
343 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  31.34 
 
 
294 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  32.34 
 
 
280 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3076  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31 
 
 
367 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.504729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2261  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.19 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  30.18 
 
 
283 aa  126  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  32.23 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1151  hypothetical protein  30.79 
 
 
347 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0127  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.6 
 
 
346 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  36.7 
 
 
287 aa  122  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  29.93 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  30.47 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  29.87 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  33.92 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  31.87 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  29.75 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  29.55 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  29.29 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  36.46 
 
 
304 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  33.73 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  28.47 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  35.23 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  35.23 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  30.04 
 
 
291 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  33.08 
 
 
304 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  32.73 
 
 
283 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  30.08 
 
 
296 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  29.14 
 
 
310 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  29.74 
 
 
289 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  36.73 
 
 
310 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  35.21 
 
 
309 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  34.6 
 
 
318 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  34.6 
 
 
354 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  34.6 
 
 
354 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  35.24 
 
 
322 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  32.37 
 
 
318 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  28.73 
 
 
290 aa  106  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  34.12 
 
 
318 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  34.12 
 
 
318 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  29.59 
 
 
287 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  34.01 
 
 
284 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  34.26 
 
 
316 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  29.57 
 
 
324 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  34.12 
 
 
329 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  34.55 
 
 
285 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  29.35 
 
 
320 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  33.65 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  29.35 
 
 
316 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  29.35 
 
 
320 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  29.35 
 
 
320 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  35.27 
 
 
319 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  35.62 
 
 
317 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  35.62 
 
 
317 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  31.65 
 
 
321 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  35.62 
 
 
317 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  35.62 
 
 
317 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  35.62 
 
 
317 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  35.62 
 
 
317 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  35 
 
 
295 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  31.85 
 
 
288 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  35.21 
 
 
321 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  29.13 
 
 
289 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  34.92 
 
 
330 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  31.48 
 
 
315 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  32.97 
 
 
306 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  34.77 
 
 
296 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  32.11 
 
 
309 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  34.4 
 
 
324 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  32.38 
 
 
317 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  33.08 
 
 
306 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  29.86 
 
 
293 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  35.9 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2759  agmatinase  26.99 
 
 
333 aa  99.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  31.18 
 
 
337 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  34.6 
 
 
317 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  33.46 
 
 
317 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  31.58 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  36.36 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>