90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3853 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3853  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  100 
 
 		 555 aa  1150    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1444  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  55.78 
 
 		 543 aa  627  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1237  hypothetical protein  56.04 
 
 		 540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  44.98 
 
 		 552 aa  503  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000539992  hitchhiker  9.52984e-19 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0386  hypothetical protein  51.97 
 
 		 241 aa  268  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1510  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.11 
 
 		 503 aa  97.4  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2236  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.93 
 
 		 504 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.182123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3507  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.83 
 
 		 503 aa  88.2  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.570315  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1563  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.29 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4871  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  25.81 
 
 		 504 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.51 
 
 		 537 aa  67  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.46 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.15 
 
 		 539 aa  65.1  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.75 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.76 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.76 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.76 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.76 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.76 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.23 
 
 		 539 aa  62  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  21.37 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.62 
 
 		 539 aa  60.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.54 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.54 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.54 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.54 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.5 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  22.54 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  22.54 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.54 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.54 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  22.92 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.36 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.28 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.36 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.43 
 
 		 529 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4617  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.77 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.01 
 
 		 537 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.26 
 
 		 539 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.32 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.76 
 
 		 530 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.76 
 
 		 530 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.87 
 
 		 538 aa  55.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.8 
 
 		 539 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  21.82 
 
 		 543 aa  54.3  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23 
 
 		 539 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.1 
 
 		 539 aa  54.3  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.39 
 
 		 542 aa  53.9  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.5 
 
 		 536 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22 
 
 		 572 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.24 
 
 		 542 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.51 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03590  phosphoenolpyruvate carboxykinase, putative  23.82 
 
 		 551 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.550693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.83 
 
 		 532 aa  50.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0013  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.33 
 
 		 538 aa  50.4  0.00008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.86 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.310956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  21.28 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.74 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  21.45 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.23 
 
 		 551 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.36 
 
 		 537 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.42 
 
 		 536 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.03 
 
 		 612 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  20.13 
 
 		 532 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  20.13 
 
 		 532 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  21.08 
 
 		 530 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71471  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.6 
 
 		 553 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  19.88 
 
 		 525 aa  47.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.32 
 
 		 525 aa  47.4  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0093  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.06 
 
 		 543 aa  47.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  20.55 
 
 		 536 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  20.17 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02560  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.15 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.128993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  20.21 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.44 
 
 		 536 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  20.21 
 
 		 571 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0223  phosphoenolpyruvate carboxykinase  20 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.86 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03951  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.22 
 
 		 520 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.949404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0168  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25 
 
 		 514 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.05 
 
 		 536 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.85 
 
 		 524 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0055  hypothetical protein  31.37 
 
 		 572 aa  44.3  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0239  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  21.48 
 
 		 530 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.94 
 
 		 524 aa  43.5  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.85 
 
 		 524 aa  43.9  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3144  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.51 
 
 		 539 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  19.9 
 
 		 537 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.83 
 
 		 534 aa  43.5  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>