173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4595 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  76.84 
 
 
542 aa  865    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 
540 aa  879    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  78.49 
 
 
540 aa  879    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.97 
 
 
535 aa  827    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.310956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
536 aa  1107    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.74 
 
 
539 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.6 
 
 
551 aa  731    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.36 
 
 
539 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0013  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.81 
 
 
538 aa  706    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.27 
 
 
539 aa  865    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.78 
 
 
543 aa  914    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.46 
 
 
538 aa  864    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.36 
 
 
539 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.36 
 
 
539 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.3 
 
 
540 aa  879    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.3 
 
 
541 aa  887    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0093  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.14 
 
 
543 aa  827    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.3 
 
 
540 aa  878    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.89 
 
 
539 aa  862    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.75 
 
 
538 aa  868    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.36 
 
 
539 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  78.49 
 
 
540 aa  879    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.92 
 
 
542 aa  877    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 
540 aa  879    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.74 
 
 
539 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.57 
 
 
525 aa  637    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.55 
 
 
539 aa  870    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.98 
 
 
539 aa  882    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.02 
 
 
542 aa  865    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 
540 aa  879    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 
540 aa  880    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.25 
 
 
525 aa  638    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.75 
 
 
539 aa  860    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4617  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 
539 aa  877    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 
540 aa  879    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02560  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.85 
 
 
538 aa  716    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.128993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.45 
 
 
539 aa  880    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.36 
 
 
539 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.11 
 
 
525 aa  628  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.5 
 
 
524 aa  620  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.55 
 
 
524 aa  616  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.93 
 
 
524 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.69 
 
 
524 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.95 
 
 
524 aa  611  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  56.95 
 
 
525 aa  610  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.51 
 
 
528 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.48 
 
 
612 aa  542  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.47 
 
 
534 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.91 
 
 
529 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.09 
 
 
536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.07 
 
 
530 aa  500  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.54 
 
 
525 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.88 
 
 
530 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.27 
 
 
530 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.27 
 
 
530 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.13 
 
 
537 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.42 
 
 
536 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.61 
 
 
528 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.45 
 
 
523 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.39 
 
 
537 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.03 
 
 
534 aa  493  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.25 
 
 
533 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.69 
 
 
530 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 
513 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.4 
 
 
526 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.96 
 
 
527 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.65 
 
 
536 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.89 
 
 
536 aa  485  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.26 
 
 
536 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.79 
 
 
528 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.35 
 
 
537 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.83 
 
 
536 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.96 
 
 
537 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.23 
 
 
549 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.01 
 
 
532 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 
499 aa  478  1e-134  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.24 
 
 
536 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.76 
 
 
530 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.48 
 
 
537 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 
528 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.63 
 
 
536 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.05 
 
 
532 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.56 
 
 
551 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.66 
 
 
537 aa  475  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.99 
 
 
572 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.41 
 
 
528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 
528 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.21 
 
 
528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.21 
 
 
528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.73 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.37 
 
 
532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 
528 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.9 
 
 
538 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.49 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.7 
 
 
538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.21 
 
 
528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.21 
 
 
528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.21 
 
 
528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.37 
 
 
532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.82 
 
 
532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.666765 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>