172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3507 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3507  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  100 
 
 
503 aa  1022    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.570315  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4871  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  62.53 
 
 
504 aa  643    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1510  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  80.12 
 
 
503 aa  839    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2236  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.16 
 
 
504 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1563  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.58 
 
 
521 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.58 
 
 
530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.58 
 
 
530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.73 
 
 
530 aa  108  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.31 
 
 
551 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.8 
 
 
536 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.22 
 
 
534 aa  104  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.77 
 
 
529 aa  103  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.36 
 
 
537 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.97 
 
 
536 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.67 
 
 
558 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.27 
 
 
537 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.21 
 
 
537 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  25.85 
 
 
529 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.33 
 
 
536 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.41 
 
 
536 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.24 
 
 
538 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.85 
 
 
549 aa  95.9  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.37 
 
 
525 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.11 
 
 
526 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.16 
 
 
540 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.16 
 
 
540 aa  94  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.529703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.16 
 
 
540 aa  94  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.16 
 
 
540 aa  94  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  26.16 
 
 
540 aa  94  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.16 
 
 
540 aa  94  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.16 
 
 
540 aa  94  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.55 
 
 
536 aa  94  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.16 
 
 
540 aa  94  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.16 
 
 
540 aa  94  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.45 
 
 
526 aa  94  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.38 
 
 
534 aa  93.6  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.52 
 
 
539 aa  93.6  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.13 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.13 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.13 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.13 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.13 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.18 
 
 
539 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.7 
 
 
543 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.57 
 
 
538 aa  92.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.51 
 
 
536 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.81 
 
 
541 aa  92.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.51 
 
 
537 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.18 
 
 
538 aa  91.3  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.38 
 
 
537 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.56 
 
 
612 aa  91.3  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.02 
 
 
513 aa  90.9  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.49 
 
 
532 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.15 
 
 
532 aa  90.1  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.2 
 
 
564 aa  90.5  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2191  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.99 
 
 
517 aa  90.1  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2217  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.11 
 
 
517 aa  89.7  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.13 
 
 
538 aa  90.1  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.6 
 
 
539 aa  89.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.59 
 
 
539 aa  89.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03951  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.1 
 
 
520 aa  89.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.949404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.69 
 
 
572 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.22 
 
 
499 aa  88.2  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.51 
 
 
534 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.99 
 
 
542 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3144  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.18 
 
 
539 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3853  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.83 
 
 
555 aa  88.2  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.02 
 
 
537 aa  87.4  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.74 
 
 
513 aa  87.8  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.9 
 
 
539 aa  87.4  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.14 
 
 
524 aa  87.8  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.41 
 
 
542 aa  87  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  25.16 
 
 
542 aa  86.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.27 
 
 
527 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.18 
 
 
528 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.35 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.68 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0535  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.02 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25 
 
 
536 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.11 
 
 
536 aa  86.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.91 
 
 
528 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4362  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.8 
 
 
513 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.26 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.26 
 
 
536 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.16 
 
 
523 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.5 
 
 
533 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4740  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.82 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.72 
 
 
525 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.45 
 
 
539 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.7 
 
 
525 aa  83.6  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.19 
 
 
531 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.24 
 
 
536 aa  83.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.32 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.83 
 
 
530 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.06 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.18 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.06 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3623  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.51 
 
 
513 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.21 
 
 
524 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1921  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.05 
 
 
539 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0333247 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>