172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55018 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.01 
 
 		 524 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.92 
 
 		 524 aa  652    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.2 
 
 		 524 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 612 aa  1280    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.01 
 
 		 524 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.77 
 
 		 525 aa  644    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.15 
 
 		 525 aa  648    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  59.2 
 
 		 525 aa  634  1e-180  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.82 
 
 		 528 aa  625  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.56 
 
 		 525 aa  627  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.25 
 
 		 524 aa  627  1e-178  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  53.32 
 
 		 542 aa  558  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.87 
 
 		 538 aa  558  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.21 
 
 		 541 aa  558  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.27 
 
 		 542 aa  555  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.48 
 
 		 542 aa  554  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.59 
 
 		 539 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.04 
 
 		 543 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  52 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.48 
 
 		 536 aa  548  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  52 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.81 
 
 		 540 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.28 
 
 		 539 aa  545  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.97 
 
 		 539 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.81 
 
 		 540 aa  544  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.64 
 
 		 538 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.16 
 
 		 539 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.28 
 
 		 539 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 		 539 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 		 539 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 		 539 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 		 539 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 		 539 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.59 
 
 		 539 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.78 
 
 		 539 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4617  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.31 
 
 		 539 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.03 
 
 		 539 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0093  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.03 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.42 
 
 		 551 aa  527  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_002950  PG1676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.57 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.310956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.13 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.61 
 
 		 513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.52 
 
 		 537 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.1 
 
 		 532 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.3 
 
 		 534 aa  509  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.27 
 
 		 564 aa  510  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.22 
 
 		 558 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.93 
 
 		 537 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.97 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.01 
 
 		 523 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.74 
 
 		 526 aa  505  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.74 
 
 		 537 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0535  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 		 535 aa  507  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.97 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02560  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.43 
 
 		 538 aa  507  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.128993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.29 
 
 		 536 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.18 
 
 		 537 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.1 
 
 		 532 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.27 
 
 		 536 aa  505  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.54 
 
 		 532 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.94 
 
 		 533 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.39 
 
 		 532 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 		 532 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.29 
 
 		 530 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.59 
 
 		 537 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.86 
 
 		 536 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.9 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.17 
 
 		 538 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.62 
 
 		 536 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.43 
 
 		 536 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.1 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.76 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.12 
 
 		 530 aa  488  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.92 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.55 
 
 		 538 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.07 
 
 		 530 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.07 
 
 		 530 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.1 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.91 
 
 		 534 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.88 
 
 		 537 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.37 
 
 		 536 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.85 
 
 		 549 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.57 
 
 		 530 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.59 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.43 
 
 		 529 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0013  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.84 
 
 		 538 aa  476  1e-133  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  50.1 
 
 		 529 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.8 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.8 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.52 
 
 		 551 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.67 
 
 		 536 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.39 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.31 
 
 		 537 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>