171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2282 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 		 540 aa  872    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  78.49 
 
 		 540 aa  872    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.32 
 
 		 535 aa  801    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.310956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.78 
 
 		 536 aa  914    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.45 
 
 		 541 aa  871    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.23 
 
 		 539 aa  857    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 		 540 aa  873    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.3 
 
 		 539 aa  844    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.29 
 
 		 551 aa  723    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.7 
 
 		 539 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0013  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.53 
 
 		 538 aa  721    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02560  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.6 
 
 		 538 aa  710    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.128993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 543 aa  1125    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.72 
 
 		 538 aa  842    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 		 540 aa  872    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 		 540 aa  872    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.44 
 
 		 539 aa  864    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.7 
 
 		 539 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0093  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.37 
 
 		 543 aa  801    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.7 
 
 		 539 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  75.8 
 
 		 542 aa  850    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.23 
 
 		 538 aa  859    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.75 
 
 		 542 aa  857    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.7 
 
 		 539 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.91 
 
 		 539 aa  863    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.23 
 
 		 539 aa  857    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.93 
 
 		 539 aa  839    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.05 
 
 		 542 aa  838    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 		 540 aa  872    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.68 
 
 		 540 aa  874    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.49 
 
 		 540 aa  872    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.99 
 
 		 539 aa  846    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4617  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.55 
 
 		 539 aa  867    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  78.49 
 
 		 540 aa  872    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.7 
 
 		 539 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.04 
 
 		 539 aa  855    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.14 
 
 		 525 aa  627  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.98 
 
 		 525 aa  622  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.36 
 
 		 524 aa  617  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.42 
 
 		 525 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.11 
 
 		 524 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.2 
 
 		 524 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.24 
 
 		 528 aa  595  1e-169  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.49 
 
 		 524 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.05 
 
 		 524 aa  598  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  56.02 
 
 		 525 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.04 
 
 		 612 aa  540  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 		 529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.09 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.53 
 
 		 536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.68 
 
 		 530 aa  508  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.33 
 
 		 525 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.2 
 
 		 523 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.63 
 
 		 527 aa  495  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.1 
 
 		 528 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.45 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.3 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.04 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.6 
 
 		 528 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.08 
 
 		 536 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.94 
 
 		 528 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.52 
 
 		 533 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.78 
 
 		 549 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.67 
 
 		 536 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.55 
 
 		 513 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.32 
 
 		 530 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.59 
 
 		 536 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.4 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.3 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 		 528 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 		 528 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.3 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.18 
 
 		 536 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 		 528 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.93 
 
 		 530 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.39 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.8 
 
 		 564 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.31 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 		 528 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.8 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.8 
 
 		 526 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.01 
 
 		 537 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.81 
 
 		 536 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.77 
 
 		 537 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.28 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.48 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.64 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.08 
 
 		 534 aa  472  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.1 
 
 		 537 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.35 
 
 		 532 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  47.69 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.59 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  46.37 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.8 
 
 		 499 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01918  Phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] (EC 4.1.1.49) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96UL8]  45.35 
 
 		 600 aa  464  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0114281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.05 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  43.77 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>