175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1563 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1563  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
521 aa  1080    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3507  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  44.58 
 
 
503 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.570315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1510  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  43.79 
 
 
503 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4871  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  41.57 
 
 
504 aa  343  5.999999999999999e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2236  phosphoenolpyruvate carboxykinase  42.77 
 
 
504 aa  333  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.69 
 
 
558 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.44 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.66 
 
 
537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.14 
 
 
537 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.22 
 
 
537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.07 
 
 
543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.88 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.77 
 
 
537 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.47 
 
 
525 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.76 
 
 
534 aa  109  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.34 
 
 
528 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.27 
 
 
537 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.27 
 
 
538 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.05 
 
 
534 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.53 
 
 
551 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0223  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.96 
 
 
536 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.91 
 
 
538 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.71 
 
 
536 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.38 
 
 
539 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.16 
 
 
540 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  25.16 
 
 
540 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.56 
 
 
537 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  25.16 
 
 
540 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.36 
 
 
532 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.16 
 
 
540 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.16 
 
 
540 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.16 
 
 
540 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.95 
 
 
540 aa  101  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.05 
 
 
536 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.51 
 
 
539 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.95 
 
 
540 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.9 
 
 
538 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.62 
 
 
529 aa  99.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.27 
 
 
536 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25 
 
 
540 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.1 
 
 
536 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.27 
 
 
536 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.61 
 
 
523 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.16 
 
 
536 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.16 
 
 
538 aa  97.8  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.08 
 
 
536 aa  97.1  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.36 
 
 
538 aa  96.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.37 
 
 
539 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.08 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.9 
 
 
539 aa  95.9  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.95 
 
 
539 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.65 
 
 
572 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.92 
 
 
533 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.03 
 
 
541 aa  94.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.63 
 
 
539 aa  93.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.52 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.52 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.52 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.52 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.52 
 
 
539 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.65 
 
 
526 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.05 
 
 
564 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4617  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.81 
 
 
539 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.19 
 
 
535 aa  91.3  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.310956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.06 
 
 
537 aa  91.3  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.1 
 
 
530 aa  90.5  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.1 
 
 
530 aa  90.5  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.05 
 
 
542 aa  90.5  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.03 
 
 
528 aa  90.1  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.67 
 
 
536 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03590  phosphoenolpyruvate carboxykinase, putative  24.28 
 
 
551 aa  88.2  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.550693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  24.95 
 
 
529 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2259  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  27.06 
 
 
529 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3853  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  22.29 
 
 
555 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.97 
 
 
561 aa  87.4  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.04 
 
 
528 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.04 
 
 
528 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.04 
 
 
528 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.04 
 
 
528 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.04 
 
 
528 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.04 
 
 
528 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.45 
 
 
532 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.16 
 
 
526 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1444  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  22.32 
 
 
543 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.04 
 
 
528 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.04 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.52 
 
 
539 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.61 
 
 
532 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.04 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.61 
 
 
532 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.52 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.59 
 
 
513 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.52 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2191  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.27 
 
 
517 aa  84.7  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.27 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2217  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.54 
 
 
517 aa  84  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.83 
 
 
513 aa  84  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1593  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.65 
 
 
539 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239491  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.53 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.53 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>