12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0055 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0055  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1165    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0701  hypothetical protein  62.83 
 
 		 573 aa  771    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02860  ATPase  48.04 
 
 		 591 aa  532  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1360  hypothetical protein  45.42 
 
 		 595 aa  501  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0387  hypothetical protein  39.89 
 
 		 576 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.177102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0318  hypothetical protein  36.78 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000251072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1908  hypothetical protein  37.94 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0404368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1627  hypothetical protein  38.05 
 
 		 568 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000849473  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1313  hypothetical protein  38.56 
 
 		 566 aa  312  1e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  25 
 
 		 552 aa  47  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000539992  hitchhiker  9.52984e-19 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1444  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  23.75 
 
 		 543 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3853  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  31.37 
 
 		 555 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>