25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1444 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1444  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  100 
 
 		 543 aa  1118    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1237  hypothetical protein  62.02 
 
 		 540 aa  702    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3853  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  55.78 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  46.92 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000539992  hitchhiker  9.52984e-19 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0386  hypothetical protein  54.8 
 
 		 241 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1510  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.62 
 
 		 503 aa  94.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1563  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.32 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3507  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  24.12 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.570315  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4871  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.16 
 
 		 504 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2236  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.182123 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.62 
 
 		 536 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.79 
 
 		 541 aa  47.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  23.36 
 
 		 529 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0055  hypothetical protein  23.75 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.13 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.14 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.76 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.48 
 
 		 538 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.77 
 
 		 551 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.87 
 
 		 551 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.87 
 
 		 539 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.73 
 
 		 536 aa  43.9  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.66 
 
 		 558 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25 
 
 		 561 aa  43.9  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.82 
 
 		 564 aa  43.5  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>