172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4871 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3507  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  62.53 
 
 
503 aa  643    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.570315  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4871  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  100 
 
 
504 aa  1021    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2236  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.61 
 
 
504 aa  730    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1510  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  62.32 
 
 
503 aa  630  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1563  phosphoenolpyruvate carboxykinase  41.57 
 
 
521 aa  343  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.29 
 
 
537 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.87 
 
 
537 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  31.53 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.82 
 
 
537 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.57 
 
 
558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.41 
 
 
513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.41 
 
 
513 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  31.05 
 
 
539 aa  113  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.49 
 
 
537 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.12 
 
 
513 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.12 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0162  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.35 
 
 
513 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.03 
 
 
538 aa  110  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.62 
 
 
537 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.76 
 
 
538 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.57 
 
 
536 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.87 
 
 
513 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.86 
 
 
536 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.44 
 
 
536 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3571  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.29 
 
 
513 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0145  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.87 
 
 
513 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0149  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.87 
 
 
513 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0148  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.61 
 
 
513 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.53 
 
 
530 aa  106  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.46 
 
 
528 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.98 
 
 
536 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3623  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.77 
 
 
513 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0101  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.99 
 
 
513 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3144  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.84 
 
 
539 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0140  phosphoenolpyruvate carboxykinase  31.21 
 
 
513 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.29 
 
 
537 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.52 
 
 
538 aa  104  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.28 
 
 
534 aa  104  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.7 
 
 
530 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.7 
 
 
530 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.82 
 
 
536 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0223  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.83 
 
 
536 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.6 
 
 
513 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.79 
 
 
536 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71471  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.47 
 
 
553 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.65 
 
 
537 aa  100  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.25 
 
 
536 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2191  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.61 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0117  phosphoenolpyruvate carboxykinase  30.09 
 
 
513 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4740  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.81 
 
 
513 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4362  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.75 
 
 
513 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.59 
 
 
532 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.35 
 
 
536 aa  98.2  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.71 
 
 
540 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.71 
 
 
540 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.39 
 
 
538 aa  98.2  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.59 
 
 
532 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.22 
 
 
564 aa  98.6  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.3 
 
 
532 aa  97.8  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.95 
 
 
541 aa  97.8  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.71 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  25.71 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  25.71 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.88 
 
 
523 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.71 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.71 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.71 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.71 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2217  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.24 
 
 
517 aa  97.4  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  28.65 
 
 
526 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.46 
 
 
532 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.51 
 
 
524 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.18 
 
 
543 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1639  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.69 
 
 
539 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0138772  normal  0.211058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1921  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.69 
 
 
539 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0333247 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.05 
 
 
525 aa  94.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.52 
 
 
527 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.8 
 
 
528 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.8 
 
 
528 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.69 
 
 
542 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.55 
 
 
529 aa  94.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.8 
 
 
528 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.8 
 
 
528 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.8 
 
 
528 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.8 
 
 
528 aa  94  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.8 
 
 
528 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.56 
 
 
524 aa  94  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.63 
 
 
539 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.63 
 
 
539 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.63 
 
 
539 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.63 
 
 
524 aa  93.6  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.63 
 
 
539 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.63 
 
 
539 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03590  phosphoenolpyruvate carboxykinase, putative  26.05 
 
 
551 aa  93.6  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.550693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.39 
 
 
528 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.63 
 
 
536 aa  93.2  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.28 
 
 
537 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.93 
 
 
534 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.32 
 
 
524 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.36 
 
 
532 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.666765 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>