51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1237 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1444  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  62.02 
 
 
543 aa  702    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1237  hypothetical protein  100 
 
 
540 aa  1110    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3853  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  56.04 
 
 
555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  47.9 
 
 
552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000539992  hitchhiker  9.52984e-19 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0386  hypothetical protein  52 
 
 
241 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1510  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  23.08 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2236  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.25 
 
 
504 aa  73.6  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1563  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.54 
 
 
521 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3507  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  23.6 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.570315  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4871  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  25.24 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.73 
 
 
532 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03590  phosphoenolpyruvate carboxykinase, putative  23.99 
 
 
551 aa  57.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.550693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.33 
 
 
530 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.33 
 
 
530 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.41 
 
 
525 aa  51.6  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2217  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.87 
 
 
517 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.72 
 
 
551 aa  51.2  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.13 
 
 
523 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.32 
 
 
525 aa  50.8  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71471  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.67 
 
 
553 aa  50.4  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.53 
 
 
538 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2191  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.87 
 
 
517 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.35 
 
 
536 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.67 
 
 
524 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.91 
 
 
572 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.67 
 
 
524 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.44 
 
 
549 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.5 
 
 
526 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.07 
 
 
524 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.27 
 
 
532 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.27 
 
 
532 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01918  Phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] (EC 4.1.1.49) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96UL8]  25.11 
 
 
600 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0114281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.02 
 
 
551 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.38 
 
 
541 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.67 
 
 
525 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.21 
 
 
537 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.49 
 
 
528 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3504  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.33 
 
 
518 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.56 
 
 
612 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.03 
 
 
530 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.81 
 
 
536 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.54 
 
 
543 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.94 
 
 
564 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.1 
 
 
534 aa  44.3  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.17 
 
 
530 aa  44.3  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  21.13 
 
 
537 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.26 
 
 
571 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.26 
 
 
571 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.89 
 
 
528 aa  43.5  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  34.83 
 
 
524 aa  43.5  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.55 
 
 
534 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>