15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1627 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1908  hypothetical protein  97.36 
 
 		 568 aa  1136    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0404368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1627  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1158    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000849473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0387  hypothetical protein  51.06 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.177102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0318  hypothetical protein  51.75 
 
 		 579 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000251072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1313  hypothetical protein  42.95 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0701  hypothetical protein  38.78 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02860  ATPase  37.2 
 
 		 591 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0055  hypothetical protein  38.05 
 
 		 572 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1360  hypothetical protein  38.1 
 
 		 595 aa  358  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  31.52 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.38 
 
 		 539 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.38 
 
 		 539 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.38 
 
 		 539 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.38 
 
 		 539 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.38 
 
 		 539 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>