172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3701 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.7 
 
 
540 aa  1056    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  93.7 
 
 
540 aa  1056    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.22 
 
 
535 aa  780    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.310956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.36 
 
 
536 aa  872    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
539 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.06 
 
 
539 aa  972    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.8 
 
 
539 aa  982    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.28 
 
 
551 aa  742    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  77.36 
 
 
542 aa  880    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0013  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.12 
 
 
538 aa  751    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  87.2 
 
 
539 aa  988    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.7 
 
 
543 aa  860    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.03 
 
 
538 aa  895    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.25 
 
 
541 aa  900    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
539 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.64 
 
 
539 aa  988    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02560  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.74 
 
 
538 aa  715    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.128993 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0093  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.81 
 
 
543 aa  847    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
539 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
539 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.49 
 
 
538 aa  1062    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.38 
 
 
542 aa  907    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.33 
 
 
540 aa  1054    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.7 
 
 
540 aa  1056    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.64 
 
 
539 aa  988    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.61 
 
 
525 aa  644    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  93.7 
 
 
540 aa  1056    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.17 
 
 
542 aa  880    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.7 
 
 
540 aa  1056    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.7 
 
 
540 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.83 
 
 
525 aa  639    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.52 
 
 
540 aa  1055    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  81.65 
 
 
539 aa  916    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4617  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.9 
 
 
539 aa  978    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.7 
 
 
540 aa  1056    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.5 
 
 
539 aa  979    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
539 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.46 
 
 
539 aa  985    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.6 
 
 
524 aa  630  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
524 aa  629  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.16 
 
 
525 aa  627  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.66 
 
 
524 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.84 
 
 
524 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.66 
 
 
524 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  56.26 
 
 
525 aa  596  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.92 
 
 
528 aa  594  1e-168  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 
612 aa  531  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 
529 aa  529  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.17 
 
 
530 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.17 
 
 
530 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.36 
 
 
530 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.01 
 
 
523 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.71 
 
 
530 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.14 
 
 
525 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.81 
 
 
534 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.99 
 
 
528 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.68 
 
 
536 aa  492  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.63 
 
 
534 aa  493  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.77 
 
 
536 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.86 
 
 
533 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.13 
 
 
536 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 
526 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  49.35 
 
 
531 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.7 
 
 
549 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.18 
 
 
538 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.4 
 
 
527 aa  484  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.5 
 
 
530 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.7 
 
 
536 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.51 
 
 
528 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.36 
 
 
537 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.63 
 
 
536 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.65 
 
 
530 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.6 
 
 
528 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.2 
 
 
499 aa  477  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.57 
 
 
536 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.8 
 
 
513 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.32 
 
 
536 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.4 
 
 
528 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.74 
 
 
537 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.31 
 
 
528 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.3 
 
 
528 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 
528 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.3 
 
 
528 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.64 
 
 
537 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.26 
 
 
537 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.18 
 
 
536 aa  475  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 
528 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.93 
 
 
529 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.3 
 
 
528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 
528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.3 
 
 
528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.88 
 
 
572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  48.49 
 
 
529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.97 
 
 
537 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01918  Phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] (EC 4.1.1.49) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96UL8]  45.71 
 
 
600 aa  462  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0114281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.71 
 
 
532 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.96 
 
 
536 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47 
 
 
532 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.61 
 
 
533 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.67 
 
 
537 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>