11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0318 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0318  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1179    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000251072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1908  hypothetical protein  51.41 
 
 
568 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0404368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1627  hypothetical protein  51.75 
 
 
568 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000849473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0387  hypothetical protein  45.94 
 
 
576 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.177102  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1313  hypothetical protein  42.98 
 
 
566 aa  395  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0055  hypothetical protein  36.78 
 
 
572 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02860  ATPase  36.28 
 
 
591 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1360  hypothetical protein  35.28 
 
 
595 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0701  hypothetical protein  34.95 
 
 
573 aa  361  2e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1155  HPr kinase  33.33 
 
 
316 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129901  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1685  HPr kinase  29.51 
 
 
311 aa  48.1  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.58788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>