10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1908 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1159    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0404368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1627  hypothetical protein  97.36 
 
 		 568 aa  1136    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000849473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0387  hypothetical protein  51.23 
 
 		 576 aa  616  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.177102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0318  hypothetical protein  51.41 
 
 		 579 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000251072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1313  hypothetical protein  39.61 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0701  hypothetical protein  38.61 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0055  hypothetical protein  37.94 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02860  ATPase  36.51 
 
 		 591 aa  369  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1360  hypothetical protein  37.72 
 
 		 595 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  31.52 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>