172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1486 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
540 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  57.87 
 
 
540 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.61 
 
 
524 aa  870    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
540 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.05 
 
 
540 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  74.76 
 
 
525 aa  793    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.26 
 
 
528 aa  774    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  57.87 
 
 
540 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.54 
 
 
524 aa  886    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  81.84 
 
 
525 aa  907    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
540 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79 
 
 
524 aa  873    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79 
 
 
524 aa  875    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
524 aa  1079    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.19 
 
 
525 aa  889    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
540 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.05 
 
 
540 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.81 
 
 
525 aa  882    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.63 
 
 
539 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.3 
 
 
538 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
540 aa  634  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
539 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.21 
 
 
538 aa  629  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
539 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.63 
 
 
539 aa  628  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
539 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
539 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.87 
 
 
539 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.52 
 
 
542 aa  624  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4617  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.74 
 
 
539 aa  621  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.36 
 
 
539 aa  621  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.25 
 
 
612 aa  621  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.82 
 
 
541 aa  621  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.93 
 
 
539 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.36 
 
 
543 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.93 
 
 
539 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.74 
 
 
539 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.93 
 
 
539 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.69 
 
 
536 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  56.39 
 
 
542 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.37 
 
 
539 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.64 
 
 
542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0093  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.42 
 
 
543 aa  587  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.09 
 
 
551 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_002950  PG1676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.93 
 
 
535 aa  561  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.310956 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.88 
 
 
530 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 
525 aa  548  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02560  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.96 
 
 
538 aa  551  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.128993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.54 
 
 
513 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0013  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.21 
 
 
538 aa  547  1e-154  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.17 
 
 
530 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.17 
 
 
530 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.52 
 
 
526 aa  541  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.51 
 
 
529 aa  538  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.34 
 
 
534 aa  536  1e-151  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.67 
 
 
528 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.47 
 
 
523 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.1 
 
 
528 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.17 
 
 
530 aa  531  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.6 
 
 
528 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.4 
 
 
499 aa  530  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.69 
 
 
528 aa  529  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 
528 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 
528 aa  527  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 
528 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 
528 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 
528 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 
528 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 
528 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 
528 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.46 
 
 
534 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 
537 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.42 
 
 
530 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.35 
 
 
536 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.7 
 
 
536 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.41 
 
 
537 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.25 
 
 
572 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.11 
 
 
537 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.33 
 
 
532 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.17 
 
 
536 aa  512  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.47 
 
 
537 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.13 
 
 
537 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.53 
 
 
536 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.94 
 
 
530 aa  511  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.71 
 
 
533 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.05 
 
 
532 aa  508  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.02 
 
 
551 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.05 
 
 
564 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.93 
 
 
536 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.45 
 
 
571 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.86 
 
 
533 aa  505  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.41 
 
 
536 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.57 
 
 
536 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.45 
 
 
571 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.62 
 
 
536 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.56 
 
 
538 aa  500  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.43 
 
 
538 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.47 
 
 
526 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.23 
 
 
537 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.54 
 
 
532 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>