170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02560 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.11 
 
 		 540 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  65.11 
 
 		 540 aa  721    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.2 
 
 		 535 aa  828    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.310956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.85 
 
 		 536 aa  716    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.11 
 
 		 539 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.1 
 
 		 539 aa  724    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.94 
 
 		 551 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0013  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.29 
 
 		 538 aa  638    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.6 
 
 		 543 aa  710    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.91 
 
 		 538 aa  720    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.74 
 
 		 539 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.1 
 
 		 539 aa  726    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.3 
 
 		 540 aa  725    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.74 
 
 		 539 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0093  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.58 
 
 		 543 aa  685    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.74 
 
 		 539 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.74 
 
 		 539 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.92 
 
 		 541 aa  727    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.81 
 
 		 538 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.74 
 
 		 539 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.11 
 
 		 540 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.1 
 
 		 542 aa  731    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.11 
 
 		 540 aa  721    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.11 
 
 		 539 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  65.11 
 
 		 540 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  65.6 
 
 		 542 aa  737    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.04 
 
 		 542 aa  731    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.11 
 
 		 540 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.11 
 
 		 540 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.86 
 
 		 539 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4617  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.55 
 
 		 539 aa  712    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.11 
 
 		 540 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02560  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 538 aa  1118    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.128993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.43 
 
 		 539 aa  704    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.43 
 
 		 539 aa  700    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.93 
 
 		 539 aa  714    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.73 
 
 		 525 aa  581  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.85 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.64 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.69 
 
 		 524 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.13 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.5 
 
 		 524 aa  551  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.96 
 
 		 524 aa  551  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.25 
 
 		 524 aa  543  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  52.22 
 
 		 525 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.66 
 
 		 528 aa  536  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.43 
 
 		 612 aa  498  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.51 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  46.95 
 
 		 531 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.43 
 
 		 525 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  46.68 
 
 		 529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.11 
 
 		 526 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  43.82 
 
 		 534 aa  451  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.44 
 
 		 527 aa  449  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.42 
 
 		 530 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  43.87 
 
 		 536 aa  445  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01918  Phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] (EC 4.1.1.49) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96UL8]  45.08 
 
 		 600 aa  440  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0114281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.51 
 
 		 523 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.08 
 
 		 536 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.79 
 
 		 528 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.3 
 
 		 549 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.66 
 
 		 551 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.07 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.07 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  43.35 
 
 		 536 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.64 
 
 		 532 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.08 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.17 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.64 
 
 		 532 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  43.51 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.41 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.22 
 
 		 534 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.26 
 
 		 532 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.13 
 
 		 538 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.22 
 
 		 532 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.13 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.62 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.22 
 
 		 528 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.24 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  42.02 
 
 		 536 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.34 
 
 		 537 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.08 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.4 
 
 		 537 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.73 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.63 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.83 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.03 
 
 		 528 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.63 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  43.55 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.83 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  42.99 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  42.8 
 
 		 530 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  42.78 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.33 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.63 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.63 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  43.18 
 
 		 530 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  42 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71471  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.19 
 
 		 553 aa  421  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.82 
 
 		 532 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>