171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1353 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.22 
 
 		 528 aa  678    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 530 aa  1093    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.03 
 
 		 528 aa  676    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.84 
 
 		 528 aa  676    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.22 
 
 		 528 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.03 
 
 		 528 aa  676    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.84 
 
 		 528 aa  686    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.84 
 
 		 528 aa  676    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.63 
 
 		 523 aa  681    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.03 
 
 		 528 aa  676    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.28 
 
 		 528 aa  687    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  83.58 
 
 		 530 aa  940    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  83.58 
 
 		 530 aa  940    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.22 
 
 		 528 aa  692    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.22 
 
 		 528 aa  678    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.08 
 
 		 513 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.03 
 
 		 528 aa  676    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.97 
 
 		 526 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.78 
 
 		 525 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.78 
 
 		 533 aa  594  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.81 
 
 		 530 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.42 
 
 		 534 aa  575  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.75 
 
 		 530 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.49 
 
 		 499 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.24 
 
 		 529 aa  571  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.06 
 
 		 536 aa  566  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.42 
 
 		 534 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.44 
 
 		 530 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.5 
 
 		 551 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.18 
 
 		 529 aa  551  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.6 
 
 		 572 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.18 
 
 		 537 aa  548  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.88 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.37 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.17 
 
 		 536 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.5 
 
 		 538 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 536 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.19 
 
 		 526 aa  544  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.99 
 
 		 533 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.61 
 
 		 536 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.32 
 
 		 536 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 536 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.45 
 
 		 525 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.71 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.2 
 
 		 571 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.2 
 
 		 571 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.59 
 
 		 537 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.1 
 
 		 536 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.32 
 
 		 525 aa  531  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.5 
 
 		 537 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.51 
 
 		 528 aa  530  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 537 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.8 
 
 		 536 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  51.83 
 
 		 531 aa  525  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.03 
 
 		 524 aa  524  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.41 
 
 		 549 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.03 
 
 		 524 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.92 
 
 		 532 aa  522  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.71 
 
 		 524 aa  523  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4740  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.4 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.37 
 
 		 534 aa  518  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.3 
 
 		 537 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.63 
 
 		 524 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.81 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.79 
 
 		 539 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51 
 
 		 532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0117  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.51 
 
 		 513 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0101  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.6 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.1 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.53 
 
 		 564 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.51 
 
 		 558 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4362  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.3 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.61 
 
 		 537 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.61 
 
 		 538 aa  511  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1049  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 		 520 aa  511  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 539 aa  511  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.68 
 
 		 543 aa  508  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.51 
 
 		 513 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.24 
 
 		 532 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0145  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.51 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0149  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.51 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.504684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.99 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  50.99 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.99 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.36 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  50.99 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0535  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.91 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0148  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.51 
 
 		 513 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 513 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 513 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.99 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.36 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3623  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.6 
 
 		 513 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3571  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.3 
 
 		 513 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.99 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.36 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.36 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.36 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.99 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.99 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>