169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01655 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.16 
 
 		 533 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.91 
 
 		 533 aa  659    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.72 
 
 		 527 aa  711    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.35 
 
 		 534 aa  808    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 536 aa  1115    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.18 
 
 		 529 aa  589  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.33 
 
 		 530 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1049  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.57 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.59 
 
 		 528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.59 
 
 		 528 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.58 
 
 		 513 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.86 
 
 		 528 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.87 
 
 		 523 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.06 
 
 		 530 aa  566  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.09 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.09 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.09 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.09 
 
 		 528 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.09 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.09 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.09 
 
 		 528 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.66 
 
 		 534 aa  564  1.0000000000000001e-159  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.09 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.21 
 
 		 530 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.21 
 
 		 530 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.57 
 
 		 530 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.38 
 
 		 526 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.9 
 
 		 528 aa  559  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.26 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.91 
 
 		 532 aa  552  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 		 530 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.63 
 
 		 499 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.38 
 
 		 536 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.93 
 
 		 525 aa  537  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.54 
 
 		 525 aa  535  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.94 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.75 
 
 		 533 aa  534  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.66 
 
 		 536 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  49.72 
 
 		 529 aa  528  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.24 
 
 		 536 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 		 529 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.58 
 
 		 536 aa  528  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.19 
 
 		 537 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.11 
 
 		 551 aa  525  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 537 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.2 
 
 		 536 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.7 
 
 		 571 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.46 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.29 
 
 		 536 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.71 
 
 		 532 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.43 
 
 		 537 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.7 
 
 		 571 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.09 
 
 		 536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.24 
 
 		 537 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.43 
 
 		 537 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.53 
 
 		 543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.8 
 
 		 524 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  49.63 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.8 
 
 		 524 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.63 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.17 
 
 		 524 aa  512  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.9 
 
 		 558 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.4 
 
 		 524 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.05 
 
 		 537 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.98 
 
 		 564 aa  511  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.13 
 
 		 532 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.83 
 
 		 532 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.51 
 
 		 528 aa  502  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 524 aa  503  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  52.1 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0535  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.18 
 
 		 535 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 542 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.02 
 
 		 526 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.05 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  48.05 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 538 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.87 
 
 		 540 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.94 
 
 		 538 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.64 
 
 		 532 aa  495  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.29 
 
 		 538 aa  498  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48 
 
 		 538 aa  495  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.5 
 
 		 539 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.79 
 
 		 542 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.05 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.05 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  48.05 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.82 
 
 		 537 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2191  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.01 
 
 		 517 aa  498  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.05 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.05 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.02 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2217  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.72 
 
 		 517 aa  495  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.01 
 
 		 539 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.68 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0101  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.61 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.68 
 
 		 537 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.68 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.34 
 
 		 532 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.34 
 
 		 532 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.87 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>