169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0101 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0148  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.11 
 
 		 513 aa  926    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4740  phosphoenolpyruvate carboxykinase  83.79 
 
 		 513 aa  905    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0162  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.69 
 
 		 513 aa  932    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0239  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.7 
 
 		 514 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0168  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.7 
 
 		 514 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0268  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.69 
 
 		 513 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730022  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0278  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.08 
 
 		 513 aa  692    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0117  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.91 
 
 		 513 aa  922    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2657  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.35 
 
 		 527 aa  742    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05450  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.8 
 
 		 532 aa  702    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.5 
 
 		 513 aa  928    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.5 
 
 		 513 aa  928    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0101  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 513 aa  1062    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68580  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.06 
 
 		 513 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.5 
 
 		 513 aa  927    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.32 
 
 		 513 aa  917    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4959  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.08 
 
 		 513 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777018  hitchhiker  0.000506151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3754  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.4 
 
 		 511 aa  750    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.3 
 
 		 513 aa  929    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3623  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.69 
 
 		 513 aa  927    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3571  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.71 
 
 		 513 aa  924    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0368  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.23 
 
 		 513 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0268  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.28 
 
 		 513 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3504  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.16 
 
 		 518 aa  721    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5935  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.64 
 
 		 513 aa  718    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0145  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.11 
 
 		 513 aa  927    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2191  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.51 
 
 		 517 aa  658    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03951  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.96 
 
 		 520 aa  797    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.949404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4362  phosphoenolpyruvate carboxykinase  82.81 
 
 		 513 aa  897    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0140  phosphoenolpyruvate carboxykinase  83.79 
 
 		 513 aa  902    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0149  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.3 
 
 		 513 aa  929    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2217  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.31 
 
 		 517 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.22 
 
 		 526 aa  558  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.61 
 
 		 532 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.98 
 
 		 528 aa  555  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.18 
 
 		 528 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.04 
 
 		 528 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.33 
 
 		 523 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.95 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.28 
 
 		 526 aa  547  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.51 
 
 		 528 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.51 
 
 		 528 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.44 
 
 		 513 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.51 
 
 		 528 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.31 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.31 
 
 		 528 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.31 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.31 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.31 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.31 
 
 		 528 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.75 
 
 		 551 aa  531  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.47 
 
 		 538 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.71 
 
 		 499 aa  520  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.6 
 
 		 530 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.85 
 
 		 536 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.2 
 
 		 530 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.97 
 
 		 536 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.37 
 
 		 536 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.1 
 
 		 536 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.54 
 
 		 564 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.46 
 
 		 537 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.29 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.29 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.98 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.29 
 
 		 572 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.51 
 
 		 529 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 530 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.27 
 
 		 536 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.2 
 
 		 536 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 532 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.61 
 
 		 536 aa  492  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 		 530 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.34 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.6 
 
 		 539 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 537 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 538 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.1 
 
 		 561 aa  475  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 		 537 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.29 
 
 		 537 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.42 
 
 		 558 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.11 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.24 
 
 		 536 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.8 
 
 		 537 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.51 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.13 
 
 		 532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.39 
 
 		 534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.45 
 
 		 525 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.23 
 
 		 571 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.31 
 
 		 537 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.23 
 
 		 571 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.9 
 
 		 525 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.7 
 
 		 532 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.72 
 
 		 538 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.92 
 
 		 549 aa  465  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.45 
 
 		 525 aa  462  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.5 
 
 		 537 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.3 
 
 		 532 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.3 
 
 		 532 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>