169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1696 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.94 
 
 
524 aa  765    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
528 aa  1093    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  70.99 
 
 
525 aa  780    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.59 
 
 
524 aa  796    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.35 
 
 
525 aa  778    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.94 
 
 
524 aa  768    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.13 
 
 
524 aa  769    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.26 
 
 
524 aa  774    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.92 
 
 
525 aa  754    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.07 
 
 
525 aa  769    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.82 
 
 
612 aa  620  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.62 
 
 
538 aa  609  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.37 
 
 
539 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.37 
 
 
539 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.62 
 
 
540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  55.62 
 
 
540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.62 
 
 
540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.62 
 
 
540 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  55.62 
 
 
540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.43 
 
 
540 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.62 
 
 
540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.62 
 
 
540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.62 
 
 
540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.18 
 
 
539 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.51 
 
 
536 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.41 
 
 
538 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4617  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.06 
 
 
539 aa  599  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.24 
 
 
543 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.92 
 
 
539 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.92 
 
 
539 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.26 
 
 
539 aa  591  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.92 
 
 
539 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.64 
 
 
539 aa  592  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.92 
 
 
539 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.92 
 
 
539 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.49 
 
 
542 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.55 
 
 
539 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00597  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.49 
 
 
542 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.03 
 
 
539 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  54.68 
 
 
542 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.03 
 
 
539 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.28 
 
 
541 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0093  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.24 
 
 
543 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0992  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.82 
 
 
551 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229448  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.63 
 
 
525 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0013  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.09 
 
 
538 aa  545  1e-154  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.5 
 
 
535 aa  542  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.310956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.91 
 
 
526 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.33 
 
 
530 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.33 
 
 
530 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02560  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.66 
 
 
538 aa  536  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.128993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.47 
 
 
513 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.86 
 
 
530 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.82 
 
 
528 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.11 
 
 
523 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.51 
 
 
530 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.71 
 
 
529 aa  528  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.39 
 
 
530 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.75 
 
 
528 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.33 
 
 
536 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.24 
 
 
537 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.02 
 
 
572 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.69 
 
 
537 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.8 
 
 
536 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.94 
 
 
528 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.14 
 
 
537 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.76 
 
 
537 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.24 
 
 
528 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.14 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.14 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.14 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.14 
 
 
528 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.14 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.14 
 
 
528 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 
530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.14 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.28 
 
 
534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.14 
 
 
528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.7 
 
 
499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.71 
 
 
537 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.71 
 
 
534 aa  506  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.45 
 
 
571 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.45 
 
 
571 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.99 
 
 
533 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.61 
 
 
538 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.51 
 
 
536 aa  502  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.8 
 
 
551 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.52 
 
 
536 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.9 
 
 
536 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.72 
 
 
536 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.78 
 
 
536 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.76 
 
 
532 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.28 
 
 
564 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.59 
 
 
536 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.18 
 
 
538 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.92 
 
 
558 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  49.9 
 
 
531 aa  497  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.2 
 
 
533 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.05 
 
 
526 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.98 
 
 
549 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>