170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6930 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.49 
 
 
533 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
533 aa  1112    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.77 
 
 
534 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.16 
 
 
536 aa  660    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.09 
 
 
523 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.45 
 
 
527 aa  621  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.13 
 
 
525 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.19 
 
 
528 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.71 
 
 
513 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.58 
 
 
528 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.97 
 
 
528 aa  593  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.28 
 
 
526 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1049  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.28 
 
 
520 aa  589  1e-167  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.51 
 
 
529 aa  588  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.01 
 
 
530 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.58 
 
 
528 aa  580  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.38 
 
 
528 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.38 
 
 
528 aa  578  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.58 
 
 
528 aa  581  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.38 
 
 
528 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.17 
 
 
572 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.58 
 
 
528 aa  579  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.58 
 
 
528 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.38 
 
 
528 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.15 
 
 
528 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.47 
 
 
530 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.66 
 
 
571 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.66 
 
 
571 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.37 
 
 
534 aa  565  1.0000000000000001e-159  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 
532 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.6 
 
 
499 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.8 
 
 
529 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.07 
 
 
530 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.98 
 
 
530 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.98 
 
 
530 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.03 
 
 
537 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.23 
 
 
532 aa  548  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.33 
 
 
536 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.99 
 
 
530 aa  542  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.63 
 
 
537 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.91 
 
 
549 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.56 
 
 
536 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.8 
 
 
533 aa  538  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.88 
 
 
537 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.91 
 
 
537 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.16 
 
 
536 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.78 
 
 
526 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.97 
 
 
537 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.19 
 
 
536 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  51.04 
 
 
531 aa  532  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.5 
 
 
537 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.19 
 
 
564 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.06 
 
 
536 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.97 
 
 
532 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.05 
 
 
532 aa  525  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 
524 aa  524  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.2 
 
 
551 aa  522  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.57 
 
 
525 aa  524  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.31 
 
 
536 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.82 
 
 
525 aa  521  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.4 
 
 
524 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.31 
 
 
524 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.52 
 
 
534 aa  517  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.05 
 
 
532 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.19 
 
 
525 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 
532 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  49.9 
 
 
529 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0535  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.91 
 
 
535 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.66 
 
 
537 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 
532 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.73 
 
 
558 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.48 
 
 
532 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.71 
 
 
524 aa  508  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01918  Phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] (EC 4.1.1.49) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96UL8]  49.7 
 
 
600 aa  505  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0114281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.38 
 
 
536 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.65 
 
 
524 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.38 
 
 
536 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0174  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.07 
 
 
539 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3978  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.26 
 
 
539 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.54 
 
 
538 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.7 
 
 
561 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  47.05 
 
 
525 aa  498  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.88 
 
 
539 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.17 
 
 
538 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.54 
 
 
539 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.34 
 
 
537 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.45 
 
 
540 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  47.45 
 
 
540 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  47.45 
 
 
540 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.61 
 
 
538 aa  498  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.45 
 
 
540 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001896  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  49.6 
 
 
542 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.76 
 
 
542 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.45 
 
 
540 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.99 
 
 
539 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.45 
 
 
540 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.26 
 
 
540 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.61 
 
 
539 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.46 
 
 
536 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3816  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.76 
 
 
538 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>