172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0313 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.24 
 
 		 537 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.03 
 
 		 536 aa  713    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.91 
 
 		 536 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.95 
 
 		 538 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 532 aa  1105    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.81 
 
 		 537 aa  689    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.9 
 
 		 534 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0535  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.73 
 
 		 535 aa  896    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.22 
 
 		 537 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.93 
 
 		 536 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.15 
 
 		 537 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.58 
 
 		 536 aa  696    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.31 
 
 		 538 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.21 
 
 		 532 aa  870    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.9 
 
 		 536 aa  711    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.55 
 
 		 537 aa  690    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.87 
 
 		 532 aa  900    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1593  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.05 
 
 		 539 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239491  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 532 aa  1105    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  94.17 
 
 		 532 aa  1028    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0223  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.36 
 
 		 536 aa  651    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.94 
 
 		 536 aa  664    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.42 
 
 		 537 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.48 
 
 		 564 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64 
 
 		 532 aa  687    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1639  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.29 
 
 		 539 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0138772  normal  0.211058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.21 
 
 		 536 aa  694    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3144  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.36 
 
 		 539 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.03 
 
 		 536 aa  709    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.2 
 
 		 537 aa  681    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.93 
 
 		 558 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.09 
 
 		 536 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1921  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.29 
 
 		 539 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  81.39 
 
 		 532 aa  917    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.96 
 
 		 561 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.28 
 
 		 529 aa  614  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.49 
 
 		 530 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.34 
 
 		 551 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.11 
 
 		 530 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.1 
 
 		 534 aa  588  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.86 
 
 		 530 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.31 
 
 		 525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.31 
 
 		 526 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.72 
 
 		 529 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.34 
 
 		 537 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.25 
 
 		 538 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.42 
 
 		 513 aa  561  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.21 
 
 		 528 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.81 
 
 		 523 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.36 
 
 		 572 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.02 
 
 		 526 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.44 
 
 		 539 aa  541  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.93 
 
 		 528 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.86 
 
 		 532 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.88 
 
 		 525 aa  526  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.88 
 
 		 525 aa  528  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.32 
 
 		 528 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.34 
 
 		 549 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 534 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.86 
 
 		 533 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.23 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.32 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.46 
 
 		 530 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.12 
 
 		 528 aa  512  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.12 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.12 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.12 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.12 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.12 
 
 		 528 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.12 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.12 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 533 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.59 
 
 		 530 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.59 
 
 		 530 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.16 
 
 		 612 aa  509  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.12 
 
 		 571 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.12 
 
 		 525 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.54 
 
 		 524 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.12 
 
 		 571 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.14 
 
 		 524 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.6 
 
 		 524 aa  503  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.34 
 
 		 536 aa  504  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  48.85 
 
 		 529 aa  502  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.95 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  50.4 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.2 
 
 		 533 aa  499  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1049  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.26 
 
 		 520 aa  496  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.75 
 
 		 524 aa  498  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  47.92 
 
 		 525 aa  492  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.37 
 
 		 528 aa  482  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.4 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.15 
 
 		 527 aa  485  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0149  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0148  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.6 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.8 
 
 		 513 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0145  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.8 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0162  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.2 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.4 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3571  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.6 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  46.73 
 
 		 540 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>