169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0365 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.02 
 
 		 536 aa  780    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.55 
 
 		 538 aa  898    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1639  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.37 
 
 		 539 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0138772  normal  0.211058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.15 
 
 		 532 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  94.6 
 
 		 537 aa  1057    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.82 
 
 		 534 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0535  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.97 
 
 		 535 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  88.08 
 
 		 537 aa  996    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 537 aa  1112    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  83.65 
 
 		 538 aa  921    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.94 
 
 		 532 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.1 
 
 		 561 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.95 
 
 		 536 aa  797    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.34 
 
 		 536 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.11 
 
 		 536 aa  759    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.78 
 
 		 536 aa  770    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.76 
 
 		 537 aa  687    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.7 
 
 		 532 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.15 
 
 		 532 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.92 
 
 		 536 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.48 
 
 		 536 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.1 
 
 		 532 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1921  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.37 
 
 		 539 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3144  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.4 
 
 		 539 aa  755    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.8 
 
 		 537 aa  965    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.3 
 
 		 564 aa  679    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.82 
 
 		 532 aa  704    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.16 
 
 		 536 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1593  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.23 
 
 		 539 aa  742    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239491  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0223  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.52 
 
 		 536 aa  777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.46 
 
 		 536 aa  775    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.33 
 
 		 537 aa  713    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.63 
 
 		 558 aa  827    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.11 
 
 		 537 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.03 
 
 		 532 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.65 
 
 		 551 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.89 
 
 		 529 aa  604  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.26 
 
 		 534 aa  593  1e-168  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.95 
 
 		 530 aa  594  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.99 
 
 		 525 aa  589  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.15 
 
 		 526 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.68 
 
 		 530 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.05 
 
 		 528 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.97 
 
 		 530 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.59 
 
 		 529 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.4 
 
 		 537 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.12 
 
 		 523 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.83 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.93 
 
 		 526 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.02 
 
 		 532 aa  545  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.02 
 
 		 534 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.78 
 
 		 528 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.71 
 
 		 538 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.26 
 
 		 533 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.01 
 
 		 539 aa  538  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.34 
 
 		 572 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.6 
 
 		 528 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.28 
 
 		 525 aa  531  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.5 
 
 		 533 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.29 
 
 		 528 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.29 
 
 		 528 aa  528  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.96 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.95 
 
 		 524 aa  530  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.96 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.29 
 
 		 528 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.09 
 
 		 528 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.29 
 
 		 528 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.29 
 
 		 528 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.29 
 
 		 528 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.29 
 
 		 528 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.29 
 
 		 528 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.5 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.5 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.69 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.6 
 
 		 533 aa  522  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 525 aa  525  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.3 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.76 
 
 		 528 aa  518  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.43 
 
 		 536 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.08 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  48.94 
 
 		 525 aa  512  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.51 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.13 
 
 		 524 aa  509  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.72 
 
 		 524 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.72 
 
 		 524 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.72 
 
 		 524 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1049  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 520 aa  504  1e-141  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.18 
 
 		 612 aa  498  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03590  phosphoenolpyruvate carboxykinase, putative  48.47 
 
 		 551 aa  487  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.550693  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.02 
 
 		 538 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  49.8 
 
 		 531 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.49 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  48.16 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.96 
 
 		 536 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.06 
 
 		 540 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2282  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.01 
 
 		 543 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.15 
 
 		 527 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.06 
 
 		 540 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.26 
 
 		 539 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  46.88 
 
 		 540 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>