170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1196 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
529 aa  1094    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.5 
 
 
534 aa  641    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.75 
 
 
536 aa  630  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.8 
 
 
530 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.04 
 
 
551 aa  622  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.98 
 
 
536 aa  621  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.56 
 
 
534 aa  618  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.5 
 
 
528 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.94 
 
 
537 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.93 
 
 
564 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.2 
 
 
532 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.62 
 
 
530 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.61 
 
 
525 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.89 
 
 
534 aa  609  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.35 
 
 
561 aa  610  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.88 
 
 
532 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.66 
 
 
537 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.64 
 
 
536 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.62 
 
 
558 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.75 
 
 
536 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.21 
 
 
537 aa  608  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.14 
 
 
536 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.84 
 
 
537 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.2 
 
 
532 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.89 
 
 
537 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.53 
 
 
536 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.89 
 
 
537 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.2 
 
 
532 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.96 
 
 
532 aa  598  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.09 
 
 
532 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.58 
 
 
536 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.19 
 
 
523 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.94 
 
 
526 aa  598  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.77 
 
 
536 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.73 
 
 
537 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.41 
 
 
537 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.92 
 
 
529 aa  594  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.72 
 
 
530 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.18 
 
 
536 aa  589  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.51 
 
 
533 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.51 
 
 
513 aa  586  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.32 
 
 
536 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.21 
 
 
532 aa  587  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.97 
 
 
538 aa  584  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.36 
 
 
499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.74 
 
 
538 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.08 
 
 
538 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.17 
 
 
532 aa  579  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0223  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.8 
 
 
536 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1921  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.41 
 
 
539 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0333247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1639  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.41 
 
 
539 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0138772  normal  0.211058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0535  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.91 
 
 
535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.38 
 
 
533 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1593  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55 
 
 
539 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239491  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.24 
 
 
530 aa  571  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.6 
 
 
528 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.56 
 
 
528 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3144  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.12 
 
 
539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.74 
 
 
530 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.74 
 
 
530 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.27 
 
 
528 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.27 
 
 
528 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.47 
 
 
528 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1952  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.85 
 
 
527 aa  561  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.76 
 
 
525 aa  561  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.36 
 
 
525 aa  560  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.08 
 
 
528 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.08 
 
 
528 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.25 
 
 
539 aa  555  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.88 
 
 
528 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.08 
 
 
528 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.88 
 
 
528 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.03 
 
 
549 aa  557  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.08 
 
 
528 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.95 
 
 
524 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.95 
 
 
524 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.36 
 
 
524 aa  558  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.47 
 
 
524 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.54 
 
 
526 aa  552  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  53.88 
 
 
529 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 
572 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.57 
 
 
525 aa  541  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.51 
 
 
524 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  52.21 
 
 
531 aa  535  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.71 
 
 
528 aa  528  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 
539 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 
539 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 
539 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 
533 aa  531  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 
539 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.73 
 
 
539 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.8 
 
 
513 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.39 
 
 
541 aa  525  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2098  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.38 
 
 
539 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832074  normal  0.0388177 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  51.15 
 
 
540 aa  525  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.77 
 
 
540 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.19 
 
 
538 aa  523  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.96 
 
 
540 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.15 
 
 
540 aa  525  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.15 
 
 
540 aa  525  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>