More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12140 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  74.28 
 
 		 418 aa  638    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12140  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 417 aa  855    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1035  Glycine hydroxymethyltransferase  72.42 
 
 		 418 aa  623  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 		 415 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61.89 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  63.2 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 421 aa  512  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 		 424 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 411 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 422 aa  506  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 424 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 424 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 431 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 412 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 416 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  64.11 
 
 		 414 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 410 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 412 aa  500  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 414 aa  495  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 424 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 427 aa  498  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 413 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 		 435 aa  491  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>