148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1350 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1350  GAF domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2111  GAF domain-containing protein  66.44 
 
 		 157 aa  200  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0371  putative GAF sensor protein  58.33 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4049  putative GAF sensor protein  55.03 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0068  putative GAF sensor protein  51.37 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4483  putative GAF sensor protein  44.74 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0473  hypothetical protein  44.74 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.253939  hitchhiker  3.4768e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4788  hypothetical protein  44.74 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00635993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1925  GAF domain-containing protein  46.31 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000712217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1032  putative GAF sensor protein  48.08 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4262  putative GAF sensor protein  48.08 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4552  hypothetical protein  44.08 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4771  hypothetical protein  44.08 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4905  hypothetical protein  44.08 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3274  sensor protein  52.41 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.622071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3325  GAF domain-containing protein  44.74 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1126  putative GAF sensor protein  48.67 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00168904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4790  hypothetical protein  44.08 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4387  hypothetical protein  44.08 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4397  hypothetical protein  44.08 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0671  putative GAF sensor protein  48 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1150  putative GAF sensor protein  48 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4762  hypothetical protein  44.08 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.01469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1028  putative GAF sensor protein  47.44 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2155  putative GAF sensor protein  48.3 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0330363  normal  0.417247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1276  putative sensor with GAF domain  51.03 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2764  hypothetical protein  48.37 
 
 		 202 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2879  hypothetical protein  48.37 
 
 		 202 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2823  hypothetical protein  48.37 
 
 		 202 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2452  hypothetical protein  48.37 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2829  hypothetical protein  48.37 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0190862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1282  GAF domain-containing protein  40.4 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000115739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1745  GAF domain-containing protein  47.71 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5928  GAF domain-containing protein  47.3 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1775  hypothetical protein  47.71 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0178  putative GAF sensor protein  46.45 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3977  sensor protein  46.88 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1746  putative GAF sensor protein  45.95 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.698368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1776  putative GAF sensor protein  45.95 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0635695  normal  0.0905724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2449  putative GAF sensor protein  46.62 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.580676  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4000  sensor protein  46.94 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2442  putative GAF sensor protein  46.62 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2562  putative GAF sensor protein  46.62 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.408148  normal  0.0780392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1902  putative GAF sensor protein  45.95 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044127  normal  0.123566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1990  putative GAF sensor protein  43.71 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0273929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1671  putative GAF sensor protein  45.95 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000389411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2204  putative GAF sensor protein  45.95 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.707038  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2907  putative GAF sensor protein  49.32 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2019  GAF domain-containing protein  41.18 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2722  putative GAF sensor protein  41.78 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1933  putative GAF sensor protein  43.84 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2603  hypothetical protein  44.59 
 
 		 152 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2807  hypothetical protein  48.98 
 
 		 150 aa  134  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174201  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0130  putative GAF sensor protein  45.95 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1452  hypothetical protein  46.76 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal  0.188383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0820  putative GAF sensor protein  45.95 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.180323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0464  putative GAF sensor protein  43.59 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000576778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0152  GAF domain-containing protein  48.63 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3668  putative GAF sensor protein  43.92 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000365673  normal  0.0790972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2117  putative GAF sensor protein  41.1 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00785932  hitchhiker  0.000244904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1784  GAF domain protein  45.62 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1502  GAF domain-containing protein  48.63 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2485  putative GAF sensor protein  43.71 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612704  normal  0.330047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1583  GAF domain-containing protein  45.58 
 
 		 153 aa  131  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4732  gafA; GAF domain-containing protein  44.03 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264042  decreased coverage  0.000031438 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0475  GAF domain-containing protein  42.96 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000747602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2131  putative GAF sensor protein  43.75 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114775  normal  0.0484243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1800  putative GAF sensor protein  42.36 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1106  hypothetical protein  40.56 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1913  putative GAF sensor protein  48.68 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0613802  normal  0.650392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03142  possible Sensor with GAF domain  46.1 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4412  GAF domain-containing protein  45.75 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1486  hypothetical protein  46.04 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0503  putative GAF sensor protein  46.36 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3610  hypothetical protein  47.66 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0239404  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2230  putative GAF sensor protein  43.24 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1542  hypothetical protein  41.67 
 
 		 150 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1877  GAF domain-containing protein  45.32 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1203  putative GAF sensor protein  40 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3838  GAF domain-containing protein  45.32 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220762  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2333  sensor protein  48.06 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1670  hypothetical protein  41.55 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000032114  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2665  hypothetical protein  41.55 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000471553  normal  0.0325611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1781  hypothetical protein  41.55 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6399  putative GAF sensor protein  42.18 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0567  GAF domain-containing protein  45.7 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2813  hypothetical protein  40.27 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0853777  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1720  GAF domain-containing protein  42.57 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000034795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003429  free methionine-(R)-sulfoxide reductase fRMsr  41.01 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000333189  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1979  putative GAF sensor protein  51.22 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.738676 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02348  hypothetical protein  39.57 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3834  putative GAF sensor protein  42.25 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.385875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2402  putative GAF sensor protein  40.13 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0097  putative GAF sensor protein  44.7 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.060889 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1057  GAF domain-containing protein  41.72 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.36357  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01791  hypothetical protein  40.28 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2565  GAF domain protein  40.28 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000383818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2100  GAF domain protein  40.28 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000646047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1800  putative GAF sensor protein  40.28 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657978  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1355  GAF domain-containing protein  40.28 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000310467  normal  0.246398 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>