102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0513 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  38.93 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  50.38 
 
 		 412 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  53.78 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  35.83 
 
 		 337 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  50.83 
 
 		 141 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  51.64 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  48.78 
 
 		 342 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  50.41 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  48.06 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  47.66 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  45.53 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  50.79 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  42.31 
 
 		 197 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  44.72 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  38.58 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  46.09 
 
 		 210 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  44.22 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  44.35 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  50 
 
 		 329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  49.59 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  47.66 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  45.83 
 
 		 135 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  38.64 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  41.61 
 
 		 353 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  50 
 
 		 328 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  47.69 
 
 		 326 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  45.97 
 
 		 350 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  43.24 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  50 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  40.82 
 
 		 343 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  47.97 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  43.65 
 
 		 333 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  49.57 
 
 		 126 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  36.95 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  43.9 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  43.9 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  42.54 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  41.13 
 
 		 344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  43.51 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  45.31 
 
 		 192 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  42.86 
 
 		 332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  38.26 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  35.62 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  39.55 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  41.8 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  37.5 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  40.32 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  47.83 
 
 		 127 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  39.84 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  36.69 
 
 		 242 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  44.17 
 
 		 345 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  42.15 
 
 		 342 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  41.32 
 
 		 340 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  32.79 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  32.79 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  39.02 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  39.29 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  40.15 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  37.3 
 
 		 365 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  39.52 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  38.52 
 
 		 336 aa  105  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  41.38 
 
 		 344 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  46.3 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  41.67 
 
 		 198 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  44.66 
 
 		 144 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  41.04 
 
 		 356 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  42.02 
 
 		 340 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  40.5 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  37.9 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  40.16 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  38.21 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  35.2 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  36.89 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  37.82 
 
 		 335 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  43 
 
 		 121 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  33.56 
 
 		 336 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  30.87 
 
 		 343 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  34.81 
 
 		 355 aa  86.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  34.81 
 
 		 355 aa  86.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  34.96 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  29.91 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  30.37 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  46.34 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  63.64 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  31.78 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  26.67 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  29.09 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  42.5 
 
 		 81 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2920  hypothetical protein  34.62 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  41.54 
 
 		 105 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  27.67 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  35.82 
 
 		 81 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  46.43 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3407  hypothetical protein  32.06 
 
 		 248 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 90 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  32.23 
 
 		 339 aa  46.2  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 164 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.454055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>