95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1889 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  758    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  62.46 
 
 		 332 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  61.37 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  54.8 
 
 		 344 aa  358  9e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  53.96 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  53.73 
 
 		 350 aa  338  9e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  52.01 
 
 		 331 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  50.15 
 
 		 334 aa  322  6e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  52 
 
 		 340 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  50.46 
 
 		 344 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  52.17 
 
 		 354 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  50.15 
 
 		 342 aa  315  9e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  50 
 
 		 358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  48.93 
 
 		 342 aa  311  7.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  50.62 
 
 		 344 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  48.17 
 
 		 343 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  52.41 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  46.69 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  46.89 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  45.75 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  44.78 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  47.2 
 
 		 345 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  47.2 
 
 		 345 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  42.82 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  42.82 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  45.06 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  47.96 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  45.54 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  47.68 
 
 		 335 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  49.22 
 
 		 365 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  44.89 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  46.44 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  43.21 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  41.5 
 
 		 352 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  48.72 
 
 		 339 aa  276  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  41.69 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  42.9 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  42.9 
 
 		 353 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  41.5 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  43.96 
 
 		 341 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  44.24 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  47.1 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  45.31 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  45 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  43.12 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  44.69 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  56.02 
 
 		 242 aa  257  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  44.69 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  44.13 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  42.86 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  39.24 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  41.74 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  46.79 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  42.41 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  43.04 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  48.43 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  40.89 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  41.53 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  34.31 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  57.14 
 
 		 197 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  57.26 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  53.78 
 
 		 291 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  51.22 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  51.26 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  58.26 
 
 		 126 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  49.59 
 
 		 141 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  50 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  49.21 
 
 		 210 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  48.39 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  48.39 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  44.27 
 
 		 334 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  55.65 
 
 		 127 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  52.17 
 
 		 144 aa  123  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  45.31 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  40.3 
 
 		 328 aa  113  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  43.2 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  39.53 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  43.9 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  43.41 
 
 		 198 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  41.54 
 
 		 135 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  43.65 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  40.98 
 
 		 192 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  38.33 
 
 		 330 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  38.76 
 
 		 329 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  46.43 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  42.11 
 
 		 121 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  33.64 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  52.31 
 
 		 81 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  48.1 
 
 		 108 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  43.75 
 
 		 88 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 90 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  39.62 
 
 		 55 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  34.29 
 
 		 77 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>