50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3008 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  160  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  50.85 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  54.24 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  49.15 
 
 		 330 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  65.91 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  65.91 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  41.89 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  58.54 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  59.09 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  55.81 
 
 		 344 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  40.35 
 
 		 281 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  37.84 
 
 		 334 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  46.15 
 
 		 337 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  52.27 
 
 		 334 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  48.94 
 
 		 330 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  35.48 
 
 		 339 aa  50.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  48.89 
 
 		 353 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  47.73 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  39.29 
 
 		 328 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  34.72 
 
 		 342 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  44.68 
 
 		 329 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  37.5 
 
 		 197 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  29.73 
 
 		 341 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  42.86 
 
 		 331 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  34.29 
 
 		 369 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  31.94 
 
 		 333 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  45.45 
 
 		 345 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  39.29 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  39.29 
 
 		 319 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  30.3 
 
 		 341 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  37.88 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  44.68 
 
 		 335 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  38.1 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  39.29 
 
 		 356 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  35.82 
 
 		 365 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  40.43 
 
 		 291 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  40 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  46.51 
 
 		 340 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  39.58 
 
 		 342 aa  42.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  44.68 
 
 		 342 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  38.78 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  38.3 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  37.5 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  26.39 
 
 		 366 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  43.75 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 340 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  36.36 
 
 		 332 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  38.78 
 
 		 327 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  30.77 
 
 		 354 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>