69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3988 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  100 
 
 
55 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  59.26 
 
 
330 aa  70.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  59.26 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  53.57 
 
 
324 aa  67  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  53.57 
 
 
324 aa  67  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  53.57 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  54.55 
 
 
353 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  55.56 
 
 
334 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  54.72 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  50 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  48.21 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  52.63 
 
 
319 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  46.3 
 
 
197 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  58.14 
 
 
335 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  45.45 
 
 
341 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  58.54 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  46.3 
 
 
339 aa  57  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  39.29 
 
 
327 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  48.21 
 
 
344 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  46.43 
 
 
291 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  48.15 
 
 
356 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  46.43 
 
 
328 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  46.3 
 
 
333 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  50 
 
 
336 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  44.64 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  54.76 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  46.3 
 
 
192 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  41.07 
 
 
281 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  40 
 
 
341 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  57.14 
 
 
164 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  42.59 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  45.45 
 
 
342 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  41.82 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  41.07 
 
 
334 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  44.64 
 
 
342 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  41.82 
 
 
354 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  38.6 
 
 
345 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  37.5 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  42.31 
 
 
330 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  50 
 
 
332 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  43.64 
 
 
365 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  39.29 
 
 
335 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  39.62 
 
 
369 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  41.51 
 
 
328 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  41.51 
 
 
326 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  42.59 
 
 
340 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  38.6 
 
 
359 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  35.71 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  46.34 
 
 
344 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  33.93 
 
 
343 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  37.04 
 
 
358 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  34.55 
 
 
344 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  39.29 
 
 
332 aa  43.5  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  40 
 
 
366 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  36.36 
 
 
342 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  50 
 
 
337 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  33.93 
 
 
352 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  39.29 
 
 
343 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  36.84 
 
 
342 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  37.04 
 
 
338 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  35.71 
 
 
331 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  37.5 
 
 
333 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  35.09 
 
 
350 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  35.19 
 
 
352 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  50 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  32.73 
 
 
345 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  32.73 
 
 
345 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  34.55 
 
 
344 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>