100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4076 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  709    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  92.67 
 
 		 341 aa  660    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  82.85 
 
 		 344 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  83.14 
 
 		 344 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  68.84 
 
 		 345 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  68.84 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  62.76 
 
 		 354 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  58.26 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  65.59 
 
 		 256 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  51.17 
 
 		 342 aa  345  8e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  50.79 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  52.61 
 
 		 338 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  49.68 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  50.46 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  50.65 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  49.53 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  47.28 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  48.92 
 
 		 365 aa  305  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  49.35 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  43.58 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  46.71 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  43.36 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  45.72 
 
 		 353 aa  298  9e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  45.89 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  46.25 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  44.68 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  46.2 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  45.16 
 
 		 359 aa  288  6e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  46.28 
 
 		 343 aa  289  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  45.79 
 
 		 335 aa  288  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  44.98 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  41.4 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  44.1 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  43.85 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  46.15 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  44.18 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  43.22 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  45.79 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  44.1 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  44.34 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  43.48 
 
 		 353 aa  281  9e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  44.16 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  44.16 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  43.23 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  48.56 
 
 		 281 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  43.18 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  45.25 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  42.01 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  42.86 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  42.86 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  40.88 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  40.75 
 
 		 357 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  40.9 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  41.42 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  40.89 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  40.82 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  38.2 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  45.73 
 
 		 242 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  31.49 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  47.11 
 
 		 197 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  48.33 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  45.76 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  49.58 
 
 		 192 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  48.76 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  39.68 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  39.68 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  50 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  49.14 
 
 		 127 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  42.98 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  48.28 
 
 		 126 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  45.45 
 
 		 141 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  43.28 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  40.32 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  37.34 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  39.67 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  38.98 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  35.43 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  33.87 
 
 		 210 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  37.9 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  34.43 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  34.43 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  38.98 
 
 		 154 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  50 
 
 		 164 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  34.15 
 
 		 198 aa  90.1  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  37.07 
 
 		 144 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  41.24 
 
 		 121 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  48.1 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  31.09 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  40.28 
 
 		 108 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  32.99 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4013  hypothetical protein  57.41 
 
 		 48 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3870  hypothetical protein  54.55 
 
 		 49 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03541  conserved hypothetical protein  54.55 
 
 		 49 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0047  conserved hypothetical protein  55.56 
 
 		 48 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  32.84 
 
 		 105 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  40 
 
 		 55 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  31.51 
 
 		 81 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1452  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 120 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0821  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 120 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  30.3 
 
 		 77 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>