14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3870 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03541  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 49 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3870  hypothetical protein  100 
 
 		 49 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0047  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4013  hypothetical protein  97.92 
 
 		 48 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  58.93 
 
 		 345 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  58.93 
 
 		 345 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  56.36 
 
 		 341 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  57.14 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  57.41 
 
 		 344 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  54.55 
 
 		 344 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  54.55 
 
 		 341 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  63.41 
 
 		 354 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  49.09 
 
 		 356 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  55 
 
 		 352 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>