53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1274 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  100 
 
 
117 aa  237  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  68.09 
 
 
337 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  45.74 
 
 
333 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  43.69 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  85.37 
 
 
281 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  42.57 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  45.26 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  45.33 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  52.05 
 
 
350 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  45.24 
 
 
357 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  42.67 
 
 
343 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  42.86 
 
 
335 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  38.71 
 
 
345 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  40 
 
 
340 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  44.44 
 
 
350 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  38.71 
 
 
345 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  40 
 
 
344 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  38.2 
 
 
342 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  34.26 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  39.13 
 
 
340 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  38.46 
 
 
359 aa  63.9  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  37.11 
 
 
341 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  32.76 
 
 
355 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  32.76 
 
 
355 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  37.11 
 
 
344 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  37.11 
 
 
344 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  37.23 
 
 
352 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  38.61 
 
 
342 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  37.08 
 
 
343 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  35.79 
 
 
353 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  36.36 
 
 
342 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  32.95 
 
 
342 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  35.79 
 
 
353 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  36.17 
 
 
351 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  37.5 
 
 
354 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  36.17 
 
 
352 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  35.92 
 
 
338 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  39.51 
 
 
334 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  34.69 
 
 
336 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  41.54 
 
 
342 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  43.94 
 
 
342 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  42.03 
 
 
339 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  42.03 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  40.58 
 
 
361 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  35.24 
 
 
356 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  30.93 
 
 
352 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  40.58 
 
 
334 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  32.99 
 
 
341 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  37.36 
 
 
331 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  28.26 
 
 
344 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  38.96 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  28.77 
 
 
369 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  26.26 
 
 
333 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>