95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0998 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  729    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  73.73 
 
 
350 aa  521  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  63.72 
 
 
343 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  59.88 
 
 
358 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  61.08 
 
 
344 aa  431  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  59.59 
 
 
342 aa  426  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  58.58 
 
 
340 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  55.72 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  55.46 
 
 
352 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  54.97 
 
 
352 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  54.9 
 
 
355 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  53.24 
 
 
353 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  54.9 
 
 
355 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  53.22 
 
 
353 aa  385  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  52.26 
 
 
357 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  54.68 
 
 
342 aa  376  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  57.05 
 
 
334 aa  363  2e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  50.59 
 
 
361 aa  358  5e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  51.54 
 
 
340 aa  339  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  51.21 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  52.63 
 
 
331 aa  332  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  48.81 
 
 
342 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  50.99 
 
 
350 aa  315  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  48.2 
 
 
333 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  50.16 
 
 
342 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  50.3 
 
 
353 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  45.64 
 
 
366 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  43.64 
 
 
359 aa  296  4e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  42.32 
 
 
345 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  48.85 
 
 
338 aa  289  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  47.62 
 
 
352 aa  289  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  49.02 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  44.71 
 
 
332 aa  282  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  44.28 
 
 
335 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  46.28 
 
 
342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  45.02 
 
 
337 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  44.12 
 
 
341 aa  268  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  46.37 
 
 
352 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  40.12 
 
 
345 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  44.34 
 
 
342 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  40.12 
 
 
345 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  43.69 
 
 
344 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  44.01 
 
 
344 aa  259  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  43.12 
 
 
369 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  42.86 
 
 
341 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  43.69 
 
 
356 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  42.09 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  42.07 
 
 
334 aa  252  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  41.49 
 
 
343 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  42.12 
 
 
354 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  44.48 
 
 
365 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  42.76 
 
 
339 aa  246  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  40.86 
 
 
335 aa  246  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  42.43 
 
 
334 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  45.32 
 
 
281 aa  239  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  39.67 
 
 
333 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  44.16 
 
 
242 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  41.87 
 
 
256 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  65.41 
 
 
144 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  35.4 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  57.02 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  56.76 
 
 
333 aa  132  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  51.59 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  45.8 
 
 
324 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  45.8 
 
 
324 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  46.15 
 
 
141 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  47.24 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  46.77 
 
 
197 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  47.41 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  47.46 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  51.79 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  45.9 
 
 
319 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  43.7 
 
 
192 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  45.76 
 
 
334 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  43.64 
 
 
154 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  41.04 
 
 
291 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  34.69 
 
 
327 aa  92.8  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  38.74 
 
 
198 aa  90.1  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  39.02 
 
 
210 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  39.67 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  35.07 
 
 
330 aa  87  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  39.67 
 
 
326 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  39.66 
 
 
126 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  40.37 
 
 
127 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  43.69 
 
 
117 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  49.32 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  37.17 
 
 
135 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  37.65 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  51.56 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  34 
 
 
108 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  35.96 
 
 
105 aa  63.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  32.98 
 
 
121 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  29.66 
 
 
221 aa  50.1  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0821  putative lipoprotein  26.74 
 
 
120 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1452  putative lipoprotein  26.74 
 
 
120 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>