95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1490 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  711    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  72.11 
 
 
340 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  65.15 
 
 
343 aa  454  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  64.07 
 
 
342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  63.14 
 
 
358 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  61.08 
 
 
356 aa  431  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  59.23 
 
 
350 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  56.76 
 
 
351 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  57.51 
 
 
355 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  57.51 
 
 
355 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  56.3 
 
 
352 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  56.01 
 
 
353 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  55.72 
 
 
352 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  55.72 
 
 
353 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  57.06 
 
 
342 aa  382  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  57.63 
 
 
334 aa  379  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  50.86 
 
 
357 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  55.86 
 
 
340 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  54.29 
 
 
344 aa  360  2e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  53.45 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  52.28 
 
 
350 aa  350  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  55.62 
 
 
331 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  52.24 
 
 
342 aa  338  9e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  48.8 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  51.51 
 
 
332 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  51.53 
 
 
333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  49.85 
 
 
353 aa  324  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  48.46 
 
 
342 aa  316  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  49.51 
 
 
336 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  47.92 
 
 
341 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  50.62 
 
 
369 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  49.69 
 
 
335 aa  308  8e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  49.35 
 
 
338 aa  305  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  45.54 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  47.28 
 
 
341 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  47.13 
 
 
352 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  44.92 
 
 
345 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  44.92 
 
 
345 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  49.84 
 
 
337 aa  297  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  47.57 
 
 
342 aa  297  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  47.39 
 
 
359 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  47.15 
 
 
344 aa  292  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  44.48 
 
 
356 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  45.66 
 
 
354 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  46.93 
 
 
342 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  45.34 
 
 
365 aa  275  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  43.35 
 
 
344 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  49.28 
 
 
281 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  45.9 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  43.42 
 
 
352 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  42.41 
 
 
343 aa  258  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  43.83 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  41.75 
 
 
334 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  40.71 
 
 
336 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  40.86 
 
 
335 aa  245  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  40.98 
 
 
333 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  50.65 
 
 
242 aa  236  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  46.72 
 
 
256 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  34.42 
 
 
344 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  50.41 
 
 
324 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  50.41 
 
 
324 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  54.17 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  51.24 
 
 
197 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  51.15 
 
 
144 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  53.39 
 
 
332 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  50.4 
 
 
329 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  52.14 
 
 
192 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  42.95 
 
 
330 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  55.96 
 
 
127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  46.67 
 
 
141 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  46.67 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  45.08 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  50.41 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  49.6 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  50.86 
 
 
126 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  41.38 
 
 
291 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  47.17 
 
 
154 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  37.1 
 
 
210 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  42.31 
 
 
334 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  30.29 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  35.54 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  41.18 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  41.18 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  38.26 
 
 
198 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  46.24 
 
 
164 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  35.96 
 
 
135 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  48.68 
 
 
105 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  35.29 
 
 
90 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  40.79 
 
 
108 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  36.96 
 
 
121 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  40 
 
 
117 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  48.21 
 
 
55 aa  56.2  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  55.81 
 
 
77 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  44.44 
 
 
81 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>